如何解决如何在允许错误的两个字符串之间提取文本
我使用以下命令在分析 DNA 序列时提取两个字符串之间的文本：
grep -o -h -P '(?
这适用于与“CACAC”或“TGTGT”完全匹配的情况
然而，有时测序错误会产生错误，而不是“CACAC”，该行可能有“CAAAC”（或任何其他碱基错误、插入或删除 - CAAAC 只是可能错误的一个例子）
我尝试过使用 agrep、tre-agrep 进行模糊匹配，但一直无法安装 ugrep。
虽然 agrep 可以很好地处理单个字符串，但它似乎不支持提取两个字符串之间的序列，至少使用我用于 grep 的语法。
有什么建议吗？
提前致谢！ -Steff2j
版权声明：本文内容由互联网用户自发贡献，该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务，不拥有所有权，不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容， 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报，一经查实，本站将立刻删除。
