如何解决系统发育树-完整 ITS 与部分 ITS
我希望通过比较覆盖 ITS 1 或 ITS 2 的读数与覆盖两个区域 (ITS1&2) 的读数来制作单个系统发育树。 （详细信息：类似的真菌、ITS 区域、~600bp 的 Sanger 读取）是否有程序/技术可以将部分读取与完整读取进行比较并且没有引物树组？
绘图：线是底漆覆盖的地方，我希望将部分线 (3-6) 与完整线 (1-2) 进行比较。
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这是对齐的图像：
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