除非在 RStudio 中运行，否则 Reticulate 编织时无法访问 Python 中的 R 变量

如何解决除非在 RStudio 中运行，否则 Reticulate 编织时无法访问 Python 中的 R 变量

我有一个包含以下内容的 RMarkdown 文档：

```{r setup,include=FALSE}
library(reticulate)
```

```{r}
#These lines don't seem to make a difference,but I have seen them suggested elsewhere
reticulate::use_python('/usr/local/Cellar/python@3.8/3.8.6_2/bin/python3.8')
knitr::knit_engines$set(python = reticulate::eng_python)
```


```{r}
py <- reticulate::py
```


```{python}
import sys
sys.version

a = 1
```


```{r python from r}
print(py$a)
b <- 2
```

```{python r from python}
print(r.b)
```

如果我在 RStudio 中以交互方式或通过编织整个文档来运行它，则一切正常，最后一块打印“2”。但是，当从 R 控制台通过 render（或我执行常规模型训练的生产脚本）运行时，它在最后一个块上失败并出现以下错误：

py_call_impl(callable,dots$args,dots$keywords) 中的错误：
运行时错误：评估错误：未找到对象“b”。

详细回溯：文件“”，第 1 行，在文件中 "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library/reticulate/python/rpytools/call.py",第 21 行，在 python_function 中引发 RuntimeError(res[kErrorKey])

从 R 访问 Python 变量似乎工作正常，但我无法在 Python 中访问 R 变量。

我使用的是 Reticulate 1.18、Knitr 1.30 和 rMarkdown 2.6。从 RStudio 和 R 控制台调用 py_config() 返回相同的结果：

>py_config()

python: /usr/local/Cellar/python@3.8/3.8.6_2/bin/python3.8 libpython:
/usr/local/opt/python@3.8/Frameworks/Python.framework/Versions/3.8/lib/python3.8/config-3.8-darwin/libpython3.8.dylib 蟒蛇之家：
/usr/local/Cellar/python@3.8/3.8.6_2/Frameworks/Python.framework/Versions/3.8:/usr/local/Cellar/python@3.8/3.8.6_2/Frameworks/Python.framework/Versions/3.8 版本：3.8.6（默认，2020 年 11 月 20 日，18:29:40）[Clang 12.0.0 (clang-1200.0.32.27)] numpy:
/usr/local/lib/python3.8/site-packages/numpy numpy_version: 1.18.5

注意：Python 版本是由 RETIculaTE_PYTHON 强制的

解决方法

看起来这在当前版本的 Reticulate 中被破坏了。我降级到 1.16 并修复了它，1.17 及更高版本已损坏。我已向开发人员提交了一张票：https://github.com/rstudio/reticulate/issues/914

编辑：现在在最新的开发版本中修复了这个问题，可以用 remotes::install_github("rstudio/reticulate") 安装