如何解决TAR 包的 rtools40 Windows 安装问题
我最近安装了 Rtools 包,用于下载和解压 TAR 包。我正在使用旧包“TCGA2STAT”中的以下代码,使用“getTCGA()”函数。
brca = getTCGA(disease = "BRCA",data.type = 'RNASeq2',clinical = TRUE,type = 'RPKM')
错误:系统中未安装 TAR。数据解压失败。
2018 年有一个类似的问题,有人回答了以下问题
Sys.setenv(TAR ="C:\\Program Files\\rtools40\\usr\\bin\\tar")
Sys.setenv(R_GZIPCMD ="C:\\Program Files\\rtools40\\usr\\bin\\gzip")
在检查它是否有效时我输入了
Sys.which('tar')
和响应
焦油 "C:\WINDOWS\SYstem32\tar.exe"
当 Sys.getenv('tar')
显示时
[1] "C:\Program Files\rtools40\usr\bin\tar.exe"
请帮忙解决这个问题。
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