如何解决运行 Snakemake
我刚刚在共享系统上安装了 Snakemake(使用 sudo),当我运行它时,即使是 snakemake --version
,我也收到了奇怪的错误:
murray@alina:~$ snakemake --version
/usr/local/lib/python3.7/site-packages/pulp/apis/gurobi_api.py:297: UserWarning: GUROBI error:
ERROR 10009: No Gurobi license found (user murray,host alina,hostid da781c18,cores 64)
.
warnings.warn('GUROBI error: {}.'.format(out))
5.31.1
我知道此错误与安装在系统上的 Gurobi 求解器(或至少其 API)的许可问题有关,但是,为什么运行 Snakemake 会引发此错误?修复此问题,甚至只是消除错误(以及在运行 gurobi.log
命令的目录中创建的结果 snakemake --version
文件)将不胜感激。
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