如何解决更新后如何在Biopython中创建没有Bio.Alphabet模块的IUPAC dna对象？
我是生物信息学的新手，所以这个问题可能有点愚蠢，但是我确实需要明确的答案，我无法在网络上的任何地方找到它。 我知道在更新之前是这样的：
select *
from (your table)
where (a,b) in (
select a,b
from (your table)
group by a,b
having count(*) > LIMIT
)
;
解决方法
从Biopython 1.78中删除了字母，因为很少需要它们并导致不必要的并发症。您可以轻松创建一个没有序列对象的对象，例如df1[df2,on =....]。如果您真的想记录您正在使用DNA / RNA /蛋白质，则必须创建一个属性或使用变量名。
如果您有兴趣，可以阅读更多有关此决定背后的历史的信息：
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