蛋白质组学实验中的P vs Q值

如何解决蛋白质组学实验中的P vs Q值

希望您能提供帮助，我对我在分析蛋白质表达的统计数据中观察到的p和q值有疑问。

我得到以下非常有意义的p值，但是Q值很高。我已经在名为progenesis的软件中进行了此分析，并希望以本论坛中介绍的方式分析这些数据。

请参阅所附图片。您从此输出中得出什么结论-因为q值太高，我不能相信p值吗？我的学习能力不足吗？也许我需要更高的n值？

有一个关于q和p值的描述，但是不清楚他们是否根据多次测试调整了p值。链接到这里：http://www.nonlinear.com/support/progenesis/comet/faq/v2.0/pq-values.aspx 我们希望根据这些数据进行更大的实验，但是我们不确定所看到的效果是否是由于随机测试问题，研究能力不足或任何其他问题所致。

感谢您的帮助， 最好的祝福， 马蒂斯

解决方法

感谢您的回答。我们得出的结论是样本量太小。虽然我们看到了效果，但样本之间的噪声引入了更多的可变性。当进行PCA分析时，我们可以看到该处理的效果，但是有些样品接近于对照：因此FDR截止率很高，使得Q值不确定。因此决定增加样本量。