如何解决尝试在R中创建phyloseq对象时出错
我正在尝试创建一个phyloseq对象,但出现错误。我搜索了不同的页面和论坛,但是找不到解决我问题的方法。如果有人可以帮助我,我将非常感谢。
我在R中运行的代码如下:
physeq <- qza_to_phyloseq(
features = "table.qza",tree = "rooted_tree.qza",taxonomy = "taxonomy.qza",Metadata = "Metadata.tsv"
)
我得到的错误是:
Error in methods::as(data[[i]],colClasses[i]) :
no method or default for coercing “character” to “Categorical”
谢谢大家。
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