如何增加R中每个边的图形距离?

如何解决如何增加R中每个边的图形距离?

我有一个CSV文件,需要绘制一个图形。

CSV file data

图形包含节点和边。

因此,我使用以下代码进行了操作。

start.time <- Sys.time()

#Loading Packages
library(igraph)
library(readr)
library(haven)

#import data
df = read.csv('../../Pre_Draw_Graph_for_R.csv',header = TRUE,encoding = 'UTF-8')

#Creating an iGraph Style Edge List
df_Edge_List <- df

#Creating Graph
df_graph = graph.data.frame(df_Edge_List,directed = TRUE)

#df Network: First Try
#Layout Options
set.seed(3500)
layout1 <- layout.fruchterman.reingold(df_graph)

#Node or vertex Options: Color
V(df_graph)$color <- "yellow"
V(df_graph)[degree(df_graph,mode = "in") > 500]$color <- "red"

#Edge Options: Size
E(df_graph)$color <- "grey"

#Plotting
plot(df_graph,vertex.label=NA)
#plot(df_graph)


end.time <- Sys.time()
time.taken <- end.time - start.time
time.taken

我可以输出以下结果,但是结果有一些问题。它表明每个节点都非常拥挤。

My Graph

enter image description here

我希望增加图形距离,但是我已经使用了很多方法。我无法解决问题。我希望得到以下结果,但是我现在不能做到。我想清楚地看到图表。

enter image description here

我使用以下内容显示了dput的结果。

dput(df_graph,file = "G.R")

由于数据太大,我使用了Google链接进行共享 https://drive.google.com/file/d/1wdF8ZKFde8bDSrFrN9e9KfD3tm6dN_s0/view?usp=sharing

有人可以帮助我吗?谢谢

解决方法

通过一些简单的更改,您就可以通过大多数方式获得漂亮的图形。首先,将顶点标签更改为数字,如第二张图中所示。另外,请使用layout_components,以使组件彼此分离。

library(igraph)

set.seed(1234)
LOC = layout_components(df_graph)
plot(df_graph,layout=LOC,vertex.label=1:vcount(df_graph))

First plot of network

可以,但是箭头很乱。这有两个原因:箭头太大,并且大多数(所有?)顶点都具有向后的环。让我们删除循环并减小箭头的大小。

Second network plot

这看起来很有用。如果您想要更好的东西,则需要开始手动移动放置不良的顶点。还有很多工作,但是您会得到更好的印象。

LOC[ 5,] = c(-1.5,-5)
LOC[ 9,] = c(-3,-2)
LOC[16,14)
LOC[21,18)
LOC[25,] = c(9,18)
LOC[29,] = c(-9,18)
LOC[35,] = c(-6,15)
LOC[30,12)
LOC[31,18)
LOC[37,] = c(1,14)
LOC[38,15)
LOC[44,18)

plot(DFGS,vertex.label=1:vcount(df_graph),edge.arrow.size = 0.5)

Third and final plot - Adjusted by hand

可以通过手动编辑完成更多工作,但我将留给您。

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