如何解决使用RDkit计算描述符
我正在尝试使用python中的RDkit计算分子列表的所有描述符(均为2D / 3D)。当我跑步时:
MolecularDescriptorCalculator.CalcDescriptors(mol,simplelist)
它返回:
AttributeError:“ Mol”对象没有属性“ simpleList”
解决方法
看起来您使用的API有点错误,您需要首先使用所需的描述符列表初始化MolecularDescriptorCalculator
类。
simplelist = ['TPSA'] # In the list add the names of the descriptors required
calculator = MolecularDescriptorCalculator(simplelist)
descriptors = calculator.CalcDescriptors(mol)
print(descriptors)
[Out]:
(21.259999999999998,)
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