如何在模块文件中设置USIF专用变量“ GLIBC”?

如何解决如何在模块文件中设置USIF专用变量“ GLIBC”?

我正在基于Slurm的HPC集群中工作,过去五年来我一直在这样做。我们加载和卸载分析所需的模块,其中包括gcc之类的编译器。直到两天前,这对我来说都是无缝的。在过去的两天内,每次尝试加载任何模块时,都会出现此错误

Couldn't set USIF specific variable "GLIBC" in modulefile - please contact
 system administration! (Refer to UMEA register_USIF.sh utility.)

互联网一直没有帮助,因为似乎已经没有任何问题可以解决。系统管理员当前未回复我的邮件,因此我的工作已完全停止。

我试图从另一台计算机和另一个帐户挂载/卸载模块,并且工作正常,因此问题与我的帐户绑定。

这里的任何人以前有这个问题的经验吗?如果是这样,可能是什么开始了?我什至不知道从哪里开始寻找,或者是什么原因导致的,因为我们没有安装自己的编译器。

编辑#1:

对于我的$LD_LIBRARY_PATH值得(不确定)的样子:

LD_LIBRARY_PATH=:/cm/shared/apps/slurm/current/lib:/cm/shared/apps/slurm/current/lib/slurm

一开始我对:有点怀疑。是否缺少第一部分?我还没有碰到这个变量。

编辑#2:

在进行其他一些挖掘之后,将我的环境与一个没有问题的同事进行了比较,我发现env中缺少以下三个变量:

UMEA_HOME=/opt/sw/UMEA/current
UMEA_INCLUDE=/opt/sw/UMEA/current/include
UMEA_CONfig=/opt/sw/UMEA/current/config

我还发现$CPATH:之类的$LD_LIBRARY_PATH开头,而他的$CPATH却不是:

CPATH=:/cm/shared/apps/slurm/current/include

我尝试export ...他们,但没有帮助。但是,这使我认为存在一个更深层次的问题。

编辑#3:

按照下面注释中的要求,我已经完成module show gcc/5.3来查看实际的模块文件。这是内容

#%Module######################################################################
##

source $env(UMEA_INCLUDE)/vsc_include.tcl
source $env(UMEA_INCLUDE)/common_include.tcl
source $env(UMEA_INCLUDE)/prereq_include.tcl

set verbosity 0
set_versions 
set base_path  [ load_unload ]
set_paths $base_path $module_name
set_version_number 2

setenv CC gcc
setenv CXX g++
setenv FC gfortran
setenv F77 gfortran
setenv F90 f95
setenv GDB gdb
setenv VSC_COMPILER_NAME ${module_name}
setenv VSC_COMPILER_VERSION ${module_version}

解决方法

与HPC群集的sysadmin一起,我们已经解决了它。这确实是一个愚蠢的事情,我发布答案只是为了让其他人也有同样的问题,知道他们要去哪里找,而又不会浪费几天的试验和错误。

问题源于$PATH。在某些情况下,您可能想通过执行$PATH来更新PATH=/my/extra/path/directory:${PATH}变量,但是在这种情况下,我必须像在PATH=${PATH}:/my/extra/path/directory中那样,将多余的路径放在最后。

直到两天前,这才成为问题,五年来它一直运行良好。也许他们在sysadmin方面做了一些更改,以便在我的$PATH中找不到所需的可执行文件。

我检查了一下,并且我是唯一在$PATH中修改了.bashrc的同事之一。那可以解释为什么只有我有这个问题。

无论如何,如果您正在阅读本文并且遇到相同的问题,那么您知道应该去哪里看看。

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。

相关推荐


Selenium Web驱动程序和Java。元素在(x,y)点处不可单击。其他元素将获得点击?
Python-如何使用点“。” 访问字典成员?
Java 字符串是不可变的。到底是什么意思?
Java中的“ final”关键字如何工作?(我仍然可以修改对象。)
“loop:”在Java代码中。这是什么,为什么要编译?
java.lang.ClassNotFoundException:sun.jdbc.odbc.JdbcOdbcDriver发生异常。为什么?
这是用Java进行XML解析的最佳库。
Java的PriorityQueue的内置迭代器不会以任何特定顺序遍历数据结构。为什么?
如何在Java中聆听按键时移动图像。
Java“Program to an interface”。这是什么意思?
Java在半透明框架/面板/组件上重新绘画。
Java“ Class.forName()”和“ Class.forName()。newInstance()”之间有什么区别?
在此环境中不提供编译器。也许是在JRE而不是JDK上运行?
Java用相同的方法在一个类中实现两个接口。哪种接口方法被覆盖?
Java 什么是Runtime.getRuntime()。totalMemory()和freeMemory()?
java.library.path中的java.lang.UnsatisfiedLinkError否*****。dll
JavaFX“位置是必需的。” 即使在同一包装中
Java 导入两个具有相同名称的类。怎么处理?
Java 是否应该在HttpServletResponse.getOutputStream()/。getWriter()上调用.close()?
Java RegEx元字符(。)和普通点?