如何解决将Pandas数据框转换为包含ID和权重的元组列表
1 2 3
1 1 0.26 0.02
2 0.26 1 0.61
3 0.02 0.61 1
这些ID由一个值连接，我想以某种方式提取所有唯一的ID值，以便以更有效的方式将它们添加到networkx上的图形中。
输出应如下所示：
ed_list = [(1,2,{'weight': 0.26}),(1,3,{'weight': 0.02}),(2,{'weight':0.61})]
目前，我使用以下方法：
# Create matrix
new_ = df.values
A_d = np.matrix(new_)
G = nx.from_numpy_matrix(A_d)
我想知道从df创建元组列表是否可以更容易/更有效，我可以用它来连接节点，然后在其中添加如下边：
G.add_edges_from(ed_list)
编辑：我在上一个版本的问题中犯了一个错误-列名和行名只是整数
解决方法
您可以尝试：
# this s is what you are looking for
s = df.where(df.index.values > df.columns.values[:,None]).stack().reset_index(name='weight')
# we can use dataframe directly
G = nx.from_pandas_edgelist(s,source='level_0',target='level_1',edge_attr='weight')
或更简单：
G = nx.from_pandas_adjacency(df)
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