如何解决通过热图识别树状图中的簇数
我正在使用heatmaply包通过dendextend包使用树状图创建热图。有没有办法确定树状图上的群集编号? 这是mtcars数据集的示例热图。我想要树状图(或图例)上的群集编号,就像我手动用红色标记的编号。 这是复制代码:
library(dendextend,datasets,heatmaply)
row_dend <- mtcars %>% dist %>% hclust %>% as.dendrogram %>%
set("branches_k_color",value = c(1:8),k = 8) %>%
set("branches_lwd",1)
col_dend <- mtcars%>% t %>% dist %>% hclust %>% as.dendrogram %>%
set("branches_k_color",1)
heatmaply_mtcars <-
heatmaply(mtcars,hclustfun = hclust,hclust_method = "ward.D2",Rowv = row_dend,Colv = col_dend,xlab = "x axis",ylab = "y axis",showticklabels = c(TRUE,TRUE),scale_fill_gradient_fun = ggplot2::scale_fill_gradient2(high = "#025492"),file = "inter_heatmap.html",column_text_angle = 30,colorbar_thickness = 50)
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