如何解决如何在选定的数据框列上应用函数,并取决于结果返回“初始值”还是返回0?
很抱歉,如果我太含糊,我绝对是R(和StackOverflow)的初学者。 为了简化(粗体部分是我真正的“目标”):
我目前有一个看起来像这样的数据框:
## Mass values Sample 1 Sample 2 Sample x Reference
## 1 50 6000 5866 36546 18000
## 2 51 8500 56547 346346 0
## 3 52 3600 7876 56856 96799
## 4 53 6324 5486 565676 68786
我想将以下函数应用于所有“ SAMPLE”列,而不是质量值。 (我是通过创建一个新的数据框来实现的,在该数据框中,我将Mass值设置为行名)。
**
- 我想应用以下格式的函数:样本值/参考值=比率X 如果比率X> 2,我想将“样本值”保留为数据帧中的初始值(而不是将其替换为由函数/比率X得出的值)。如果Ratio X
- 在“参考= 0”的情况下,该功能不应应用于数据帧中特定行的采样值。 ** 我试过使用apply()和sapply(),这应用了该函数,但在dataframe列中将解决方案作为新值返回。我无法找到一种方法来仅“检查”列值并根据函数的解决方案返回值。我也尝试了if else语句来执行此操作,但是这一直在返回错误。我也尝试过: Ratio_X
解决方法
dplyr
软件包使之可行。这是第一部分(将“参考”值不为零但大于“样本”值一半的“样本”列中的那些值替换为零。
library(dplyr)
data <- structure(list(`Mass values` = c(50,51,52,53),`Sample 1` = c(6000,8500,3600,6324),`Sample 2` = c(5866,56547,7876,5486),`Sample x` = c(36546,346346,56856,565676),Reference = c(18000,96799,68786)),row.names = c(NA,-4L),class = c("tbl_df","tbl","data.frame"))
data1 <- data %>%
# mutate changes values in columns
mutate(across(starts_with("Sample"),# across(starts_with()) only uses the Sample columns
~ case_when(Reference == 0 ~ .,# if Reference == 0,return original value
# if value / Reference is > 2,return original value,else 0
TRUE ~ if_else(. / Reference > 2,.,0 )) ))
# A tibble: 4 x 5
`Mass values` `Sample 1` `Sample 2` `Sample x` Reference
<dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 50 0 0 36546 18000
2 51 8500 56547 346346 0
3 52 0 0 0 96799
4 53 0 0 565676 68786
删除零点有些棘手。这有两种方法。
# Replace with NA
data1 %>% na_if(0)
# A tibble: 4 x 5
`Mass values` `Sample 1` `Sample 2` `Sample x` Reference
<dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 50 NA NA 36546 18000
2 51 8500 56547 346346 NA
3 52 NA NA NA 96799
4 53 NA NA 565676 68786
# Pivot longer and remove rows with zero.
library(tidyr)
data1 %>% pivot_longer(cols = starts_with("Sample"),names_to = "Sample") %>%
filter(value != 0)
# A tibble: 5 x 4
`Mass values` Reference Sample value
<dbl> <dbl> <chr> <dbl>
1 50 18000 Sample x 36546
2 51 0 Sample 1 8500
3 51 0 Sample 2 56547
4 51 0 Sample x 346346
5 53 68786 Sample x 565676
版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。