如何解决无法通过conda env访问jarfile
我通过conda下载了一个名为“ beagle”的Java软件(已经安装了 java-jdk 和 java )。当我运行Nextflow(NF)管道(在NF的过程中使用软件)时,它说:
无法访问jarfile beagle.24Aug19.3e8.jar
我激活了conda env,检查了软件的位置,它在其中
/share/beagle-5.1_24Aug19.3e8-0/beagle.jar
示例用法如下:
java -jar beagle.24Aug19.3e8.jar
所以,我的命令是正确的。我尝试了NF过程中的所有组合,例如:
- java -jar /share/beagle-5.1_24Aug19.3e8-0/beagle.jar
- java -jar beagle.24Aug19.3e8.jar
- java -jar beagle.jar
- java -jar /share/beagle-5.1_24Aug19.3e8-0/beagle.24Aug19.3e8.jar
我想念什么?为什么无法访问?谢谢!
干杯
解决方法
好的,我解决了,但是忘了在这里更新。实际上,工具手册说该软件的使用应与以下软件一起使用:
java -jar beagle.jar
它仅与“ beagle ”命令一起使用。未删除该帖子,因为它可能对其他事情很有帮助。
干杯
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