拆开保存熊猫数据框的字典会抛出AttributeError：'Dataframe'对象没有属性'_data'

如何解决拆开保存熊猫数据框的字典会抛出AttributeError：'Dataframe'对象没有属性'_data'

我有一个类来执行分析并将结果（即熊猫数据框）附加为对象属性：

>>> print(test.image.locate_DF)
              y          x       mass  ...    raw_mass        ep  frame
0     60.177142  59.788709  33.433414  ...  242.080256       NaN      0
1     60.651991  59.773904  33.724308  ...  242.355784       NaN      1
2     60.790437  60.190234  31.117164  ...  236.276671       NaN      2
3     60.771933  60.048123  33.558372  ...  240.981395       NaN      3
4     60.251282  59.775139  31.881009  ...  239.239022       NaN      4
...         ...        ...        ...  ...         ...       ...    ...
7212  68.186380  76.477449  18.122817  ...  176.523091       NaN   9410
7213  68.764444  76.574091  17.486454  ...  173.448306       NaN   9415
7214  68.191152  76.473477  17.402975  ...  172.848119  0.868326   9429
7215  67.034103  76.025885  17.010951  ...  170.928067 -0.600854   9431
7216  68.583276  75.309592  17.852992  ...  178.271558       NaN   9432

随后，我将所有重要的对象属性保存在字典中，然后将其腌制以备后用：

def save_parameters(self,filepath):
        
        param_dict = {}

    try:
            self.image.locate_DF
        except AttributeError:
            pass
        else:
            param_dict['optical_locate_DF'] = self.image.locate_DF

    with open(filepath,'wb') as handle:
            pickle.dump(param_dict,handle,5)

当尝试加载该腌制文件时，我一点都没有问题，数据帧完美加载：

>>> test.save_parameters('test.pickle')
>>> with open('test.pickle','rb') as handle:
...     result = pickle.load(handle)
...
>>> print(result.keys())
dict_keys(['optical_path','optical_feature_diameter','optical_feature_minmass','optical_locate_DF','electrical_path','electrical_raw_data','electrical_processed_data','electrical_mean_voltage'])
>>> print(result['optical_locate_DF'])
              y          x       mass  ...    raw_mass        ep  frame
0     60.177142  59.788709  33.433414  ...  242.080256       NaN      0
1     60.651991  59.773904  33.724308  ...  242.355784       NaN      1
2     60.790437  60.190234  31.117164  ...  236.276671       NaN      2
3     60.771933  60.048123  33.558372  ...  240.981395       NaN      3
4     60.251282  59.775139  31.881009  ...  239.239022       NaN      4
...         ...        ...        ...  ...         ...       ...    ...
7212  68.186380  76.477449  18.122817  ...  176.523091       NaN   9410
7213  68.764444  76.574091  17.486454  ...  173.448306       NaN   9415
7214  68.191152  76.473477  17.402975  ...  172.848119  0.868326   9429
7215  67.034103  76.025885  17.010951  ...  170.928067 -0.600854   9431
7216  68.583276  75.309592  17.852992  ...  178.271558       NaN   9432

[7217 rows x 9 columns]

但是，在对HPC上的这些文件中的一堆文件进行分析之后，然后尝试打开相同的腌制文件（其名称现在不同，但与上面显示的相同，并对其执行了相同的分析），我被熊猫抛出属性错误。它指出数据框没有“ _data”属性。字典具有相同的键，并且打印出不是数据框的键没有任何问题：

>>> resultfile = '../results/diam_15_minmass_17_dist_50_mem_5000_tracklength_500/R9_DNA_50mV_001.pickle'
>>> with open(resultfile,'optical_tracking_distance','optical_tracking_memory','optical_tracking_DF','optical_kinetics_DF','electrical_mean_voltage'])
>>> print(result['optical_locate_DF'])
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>",line 1,in <module>
  File "/Users/stevenvanuytsel/miniconda3/envs/simultaneous_measurements/lib/python3.8/site-packages/pandas/core/frame.py",line 680,in __repr__
    self.to_string(
  File "/Users/stevenvanuytsel/miniconda3/envs/simultaneous_measurements/lib/python3.8/site-packages/pandas/core/frame.py",line 801,in to_string
    formatter = fmt.DataFrameFormatter(
  File "/Users/stevenvanuytsel/miniconda3/envs/simultaneous_measurements/lib/python3.8/site-packages/pandas/io/formats/format.py",line 593,in __init__
    self.max_rows_displayed = min(max_rows or len(self.frame),len(self.frame))
  File "/Users/stevenvanuytsel/miniconda3/envs/simultaneous_measurements/lib/python3.8/site-packages/pandas/core/frame.py",line 1041,in __len__
    return len(self.index)
  File "/Users/stevenvanuytsel/miniconda3/envs/simultaneous_measurements/lib/python3.8/site-packages/pandas/core/generic.py",line 5270,in __getattr__
    return object.__getattribute__(self,name)
  File "pandas/_libs/properties.pyx",line 63,in pandas._libs.properties.AxisProperty.__get__
  File "/Users/stevenvanuytsel/miniconda3/envs/simultaneous_measurements/lib/python3.8/site-packages/pandas/core/generic.py",name)
AttributeError: 'DataFrame' object has no attribute '_data'

我已经研究了泡菜手册，并提出了许多SO问题，但是我似乎无法找出问题所在。有谁知道如何解决此问题，以及我是否仍然可以访问该数据？

解决方法

我有同样的问题。我在使用Pandas 1.1.1的环境中生成了Pandas数据框，并将其保存到pickle文件中。

with open('file.pkl','wb') as f:
    pickle.dump(data_frame_object,f)

在另一个会话中将其解开并打印数据框后，我遇到了相同的错误。在不同环境中的一些测试显示了以下模式：

熊猫环境> = 1.1.0：有效
熊猫环境== 1.0.5：错误消息如上所述
熊猫环境== 1.0.3：内核崩溃

使用HDF5格式时出现相同的错误，因此似乎与数据框和不同的Pandas版本存在兼容性问题。

在受影响的环境中将熊猫更新到1.1.1为我解决了这个问题。

经过长时间艰苦的交叉检查模块版本之后，我发现此错误是由于pandas版本中的更新引起的。我的Mac仍然运行pandas 1.0.5，而hpc运行pandas 1.1.0。显然，两者之间是不匹配的（不确定是在酸洗之后还是用于保存的其他文件格式）。

也许问题已经解决了。
Emmm，但我仍然想添加一些评论。

我将pkl文件保存在服务器上，但是当我将其加载到MAC上时，它崩溃了，显示'Dataframe' object has no attribute '_data'

最后，我发现Mac上的熊猫是1.0.5，而服务器上是1.1.5。当我将其更新为最新版本时，它就可以正常工作。