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使用XML2从PubMed XML产生数据框

如何解决使用XML2从PubMed XML产生数据框

我已经在生成代码方面获得了一些帮助:

library( xml2 )
library( magrittr )

#read the xml-data
doc <- xml2::read_xml( "https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=pubmed&id=20301425&retmode=xml" )

pmid    <- xml2::xml_find_first( doc,".//PMID") %>% xml2::xml_text()
authors <- paste( 
  xml2::xml_find_all( doc,".//AuthorList[@Type = 'authors']/Author/LastName") %>% xml2::xml_text(),xml2::xml_find_all( doc,".//AuthorList[@Type = 'authors']/Author/ForeName") %>% xml2::xml_text(),sep = "," )
affiliate <- xml2::xml_find_all( doc,".//AuthorList[@Type = 'authors']/Author/AffiliationInfo/Affiliation") %>% xml2::xml_text()

df <- data.frame( pmid = pmid,authors = authors,affiliate = affiliate )

代码创建了一个数据框,提取了有关pmid,作者和隶属关系的信息。我的下一个问题是,您可以从关联信息中提取有关州/国家/地区的特定信息,以便在数据框中有一个包含此信息的附加列吗? enter image description here

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