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如何使用GUI选择cytoscape中两个选定节点之间的所有边缘

如何解决如何使用GUI选择cytoscape中两个选定节点之间的所有边缘

有人知道如何使用GUI选择cytoscape中两个选定节点之间的所有边缘吗?

如果这是一个小型网络,这将很容易手动完成,但在我的情况下,节点数超过1万。 理想情况下,我想选择70个节点列表之间的所有边。

谢谢。

解决方法

嗯,令我惊讶的是,答案是“不”,我不知道选择连接两个节点的边的简便方法。不过,我有一种“ hacky”的方法可以奏效,

  1. 选择所需的所有节点
  2. 执行文件->新建网络->从选定节点,所有边缘。这将为您提供一个仅包含选定节点和连接它们的边缘的新网络。现在,将所有这些边的“共享互动”列更改为唯一的内容(例如选择)。此列在您创建的子网和原始网络之间共享。
  3. 现在,回到原始网络,用户可以使用“过滤器”面板创建一个列过滤器,以共享交互方式选择“选择”来查找所有边。然后将选择它们。

可能比您想要的复杂得多,但是它将完成此工作。我还建议添加一个功能请求(帮助->报告错误),以选择连接所选节点的边。

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