如何解决使用xgb和XGBclassifier的CPU比GPU更快 1.您的 GPU CUDA 是否已启用?2.您是否使用了可能受 GPU 使用影响的参数?3.您是否正在配置参数以使用 GPU 支持?4.数据
我是个初学者,请先道歉。我正在尝试使用xgb和XGBclassifier使用XGBoost进行GPU与cpu的测试。结果如下:
passed time with xgb (gpu): 0.390s
passed time with XGBClassifier (gpu): 0.465s
passed time with xgb (cpu): 0.412s
passed time with XGBClassifier (cpu): 0.421s
我想知道为什么cpu的性能似乎不比GPU好。 这是我的设置:
- Python 3.6.1
- 操作系统:Windows 10 64bit
- GPU:NVIDIA RTX 2070 Super 8gb vram(驱动程序已更新至最新版本)
- 已安装CUDA 10.1
- cpu i7 10700 2.9Ghz
- 在Jupyter Notebook上运行
- 通过pip安装了xgboost 1.2.0的夜间版本
**还尝试使用通过pip从预构建的二进制车轮安装的xgboost版本:相同问题
param = {'max_depth':5,'objective':'binary:logistic','subsample':0.8,'colsample_bytree':0.8,'eta':0.5,'min_child_weight':1,'tree_method':'gpu_hist'
}
num_round = 100
dtrain = xgb.DMatrix(X_train2,y_train)
tic = time.time()
model = xgb.train(param,dtrain,num_round)
print('passed time with xgb (gpu): %.3fs'%(time.time()-tic))
xgb_param = {'max_depth':5,'learning_rate':0.5,'tree_method':'gpu_hist'}
model = xgb.XGBClassifier(**xgb_param)
tic = time.time()
model.fit(X_train2,y_train)
print('passed time with XGBClassifier (gpu): %.3fs'%(time.time()-tic))
param = {'max_depth':5,'tree_method':'hist'}
num_round = 100
dtrain = xgb.DMatrix(X_train2,num_round)
print('passed time with xgb (cpu): %.3fs'%(time.time()-tic))
xgb_param = {'max_depth':5,'tree_method':'hist'}
model = xgb.XGBClassifier(**xgb_param)
tic = time.time()
model.fit(X_train2,y_train)
print('passed time with XGBClassifier (cpu): %.3fs'%(time.time()-tic))
我尝试合并Sklearn网格搜索以查看是否可以在GPU上获得更快的速度,但最终却比cpu慢得多:
passed time with XGBClassifier (gpu): 2457.510s
Best parameter (CV score=0.490):
{'xgbclass__alpha': 100,'xgbclass__eta': 0.01,'xgbclass__gamma': 0.2,'xgbclass__max_depth': 5,'xgbclass__n_estimators': 100}
passed time with XGBClassifier (cpu): 383.662s
Best parameter (CV score=0.487):
{'xgbclass__alpha': 100,'xgbclass__eta': 0.1,'xgbclass__max_depth': 2,'xgbclass__n_estimators': 20}
我正在使用具有75k观测值的数据集。知道为什么我不能从使用GPU获得加速吗?数据集是否太小而无法从使用GPU获得收益?
任何帮助将不胜感激。非常感谢!
解决方法
有趣的问题。正如您所注意到的,在 Github 和官方 xgboost site
上已经注意到了一些这样的例子:
- https://github.com/dmlc/xgboost/issues/2819
- https://discuss.xgboost.ai/t/no-gpu-usage-when-using-gpu-hist/532
还有其他人发布了类似的问题:
看着 official xgboost
documentation,there is an extensive section on GPU support。
有几件事需要检查。文档指出:
可以加速树的构建(训练)和预测 支持 CUDA 的 GPU。
1.您的 GPU CUDA 是否已启用?
2.您是否使用了可能受 GPU 使用影响的参数?
请记住,只有某些参数才能从使用 GPU 中受益。这些是:
是的,您是。其中大部分都包含在您的超参数集中,这是一件好事。
{subsample,sampling_method,colsample_bytree,colsample_bylevel,max_bin,gamma,gpu_id,predictor,grow_policy,monotone_constraints,interaction_constraints,single_precision_histogram}
3.您是否正在配置参数以使用 GPU 支持?
如果您查看 XGBoost Parameters page,您可以找到可能有助于改善您的时间的其他方面。例如,updater
可以设置为 grow_gpu_hist
,这(注意,这是没有意义的,因为您设置了 tree_method
,但对于笔记):
grow_gpu_hist:使用 GPU 生长树。
在参数页面的底部,还有 gpu_hist
启用的附加参数,特别是 deterministic_histogram
(注意,这是没有实际意义的,因为它默认为 True
):
确定性地在 GPU 上构建直方图。直方图构建不是 由于浮点的非关联方面而具有确定性 总结。我们采用预舍入程序来缓解问题, 这可能会导致精度略低。设置为 false 以禁用它。
4.数据
我用一些数据进行了一些有趣的实验。由于我无权访问您的数据,因此我使用了 sklearn
的 make_classification
,它生成数据 in a rather robust way。
我对您的脚本进行了一些更改,但没有发现任何变化:我更改了 gpu 与 cpu 示例的超参数,我运行了 100 次并取得了平均结果等。对我来说似乎没有什么特别突出的。我记得我曾经使用 XGBoost
GPU 与 CPU 功能来加速一些分析,但是,我正在研究一个更大的数据集。
我稍微编辑了您的脚本以使用这些数据,并开始将数据集中 samples
和 features
的数量(通过 n_samples
和 n_features
参数)更改为观察对运行时的影响。对于高维数据来说,似乎 GPU 会显着提高训练时间,但是对于许多样本的批量数据并没有看到巨大的改进。请参阅下面的我的脚本:
import xgboost as xgb,numpy,time
from sklearn.datasets import make_classification
from sklearn.model_selection import train_test_split
xgb_gpu = []
xgbclassifier_gpu = []
xgb_cpu = []
xgbclassifier_cpu = []
n_samples = 75000
n_features = 500
for i in range(len(10)):
n_samples += 10000
n_features += 300
# Make my own data since I do not have the data from the SO question
X_train2,y_train = make_classification(n_samples=n_samples,n_features=n_features*0.9,n_informative=n_features*0.1,n_redundant=100,flip_y=0.10,random_state=8)
# Keep script from OP intact
param = {'max_depth':5,'objective':'binary:logistic','subsample':0.8,'colsample_bytree':0.8,'eta':0.5,'min_child_weight':1,'tree_method':'gpu_hist','gpu_id': 0
}
num_round = 100
dtrain = xgb.DMatrix(X_train2,y_train)
tic = time.time()
model = xgb.train(param,dtrain,num_round)
print('passed time with xgb (gpu): %.3fs'%(time.time()-tic))
xgb_gpu.append(time.time()-tic)
xgb_param = {'max_depth':5,'learning_rate':0.5,'gpu_id':0}
model = xgb.XGBClassifier(**xgb_param)
tic = time.time()
model.fit(X_train2,y_train)
print('passed time with XGBClassifier (gpu): %.3fs'%(time.time()-tic))
xgbclassifier_gpu.append(time.time()-tic)
param = {'max_depth':5,'tree_method':'hist'}
num_round = 100
dtrain = xgb.DMatrix(X_train2,num_round)
print('passed time with xgb (cpu): %.3fs'%(time.time()-tic))
xgb_cpu.append(time.time()-tic)
xgb_param = {'max_depth':5,'tree_method':'hist'}
model = xgb.XGBClassifier(**xgb_param)
tic = time.time()
model.fit(X_train2,y_train)
print('passed time with XGBClassifier (cpu): %.3fs'%(time.time()-tic))
xgbclassifier_cpu.append(time.time()-tic)
import pandas as pd
df = pd.DataFrame({'XGB GPU': xgb_gpu,'XGBClassifier GPU': xgbclassifier_gpu,'XGB CPU': xgb_cpu,'XGBClassifier CPU': xgbclassifier_cpu})
#df.to_csv('both_results.csv')
我在相同的数据集上单独和一起更改每个(样本、特征)。查看以下结果:
| Interval | XGB GPU | XGBClassifier GPU | XGB CPU | XGBClassifier CPU | Metric |
|:--------:|:--------:|:-----------------:|:--------:|:-----------------:|:----------------:|
| 0 | 11.3801 | 12.00785 | 15.20124 | 15.48131 | Changed Features |
| 1 | 15.67674 | 16.85668 | 20.63819 | 22.12265 | Changed Features |
| 2 | 18.76029 | 20.39844 | 33.23108 | 32.29926 | Changed Features |
| 3 | 23.147 | 24.91953 | 47.65588 | 44.76052 | Changed Features |
| 4 | 27.42542 | 29.48186 | 50.76428 | 55.88155 | Changed Features |
| 5 | 30.78596 | 33.03594 | 71.4733 | 67.24275 | Changed Features |
| 6 | 35.03331 | 37.74951 | 77.68997 | 75.61216 | Changed Features |
| 7 | 39.13849 | 42.17049 | 82.95307 | 85.83364 | Changed Features |
| 8 | 42.55439 | 45.90751 | 92.33368 | 96.72809 | Changed Features |
| 9 | 46.89023 | 50.57919 | 105.8298 | 107.3893 | Changed Features |
| 0 | 7.013227 | 7.303488 | 6.998254 | 9.733574 | No Changes |
| 1 | 6.757523 | 7.302388 | 5.714839 | 6.805287 | No Changes |
| 2 | 6.753428 | 7.291906 | 5.899611 | 6.603533 | No Changes |
| 3 | 6.749848 | 7.293555 | 6.005773 | 6.486256 | No Changes |
| 4 | 6.755352 | 7.297607 | 5.982163 | 8.280619 | No Changes |
| 5 | 6.756498 | 7.335412 | 6.321188 | 7.900422 | No Changes |
| 6 | 6.792402 | 7.332112 | 6.17904 | 6.443676 | No Changes |
| 7 | 6.786584 | 7.311666 | 7.093638 | 7.811417 | No Changes |
| 8 | 6.7851 | 7.30604 | 5.574762 | 6.045969 | No Changes |
| 9 | 6.789152 | 7.309363 | 5.751018 | 6.213471 | No Changes |
| 0 | 7.696765 | 8.03615 | 6.175457 | 6.764809 | Changed Samples |
| 1 | 7.914885 | 8.646722 | 6.997217 | 7.598789 | Changed Samples |
| 2 | 8.489555 | 9.2526 | 6.899783 | 7.202334 | Changed Samples |
| 3 | 9.197605 | 10.02934 | 7.511708 | 7.724675 | Changed Samples |
| 4 | 9.73642 | 10.64056 | 7.918493 | 8.982463 | Changed Samples |
| 5 | 10.34522 | 11.31103 | 8.524865 | 9.403711 | Changed Samples |
| 6 | 10.94025 | 11.98357 | 8.697257 | 9.49277 | Changed Samples |
| 7 | 11.80717 | 12.93195 | 8.734307 | 10.79595 | Changed Samples |
| 8 | 12.18282 | 13.38646 | 9.175231 | 10.33532 | Changed Samples |
| 9 | 13.05499 | 14.33106 | 11.04398 | 10.50722 | Changed Samples |
| 0 | 12.43683 | 13.19787 | 12.80741 | 13.86206 | Changed Both |
| 1 | 18.59139 | 20.01569 | 25.61141 | 35.37391 | Changed Both |
| 2 | 24.37475 | 26.44214 | 40.86238 | 42.79259 | Changed Both |
| 3 | 31.96762 | 34.75215 | 68.869 | 59.97797 | Changed Both |
| 4 | 41.26578 | 44.70537 | 83.84672 | 94.62811 | Changed Both |
| 5 | 49.82583 | 54.06252 | 109.197 | 108.0314 | Changed Both |
| 6 | 59.36528 | 64.60577 | 131.1234 | 140.6352 | Changed Both |
| 7 | 71.44678 | 77.71752 | 156.1914 | 161.4897 | Changed Both |
| 8 | 81.79306 | 90.56132 | 196.0033 | 193.4111 | Changed Both |
| 9 | 94.71505 | 104.8044 | 215.0758 | 224.6175 | Changed Both |
随着我开始研究更多;这是有道理的。 众所周知,GPU 可以很好地处理高维数据,如果您的数据是高维数据,那么您会看到训练时间的改善是有道理的。请参阅以下示例:
- https://projecteuclid.org/download/pdfview_1/euclid.ss/1294167962
- Faster Kmeans Clustering on High-dimensional Data with GPU Support
- https://link.springer.com/article/10.1007/s11063-014-9383-4
虽然我们不能确定无法访问您的数据,但当您的数据支持 GPU 的硬件功能时,它的硬件功能似乎可以显着提高性能,而且考虑到 GPU 的大小和形状,情况似乎并非如此您拥有的数据。
,这似乎与您使用的学习问题和超参数有关。我可以验证我有两个不同的数据集,并且其中一个在 GPU 上的训练速度更快,而另一个则更慢。
具体来说,xgboost 提供了一个基准 docs,download
python tests/benchmark/benchmark_tree.py --tree_method=gpu_hist
python tests/benchmark/benchmark_tree.py --tree_method=hist
在我的硬件上,gpu_hist
比 hist
快 4 倍。
同时,我还有另一个大型数据集,其中 gpu_hist
比 hist
慢 4 倍。
.选择 CPU 还是 GPU
神经网络的复杂性还取决于输入特征的数量,而不仅仅是隐藏层中的单元数量。如果您的隐藏层有 50 个单元,并且数据集中的每个观察值都有 4 个输入特征,那么您的网络很小(约 200 个参数)。如果在某些大型上下文中,每个观察值都有 500 万个输入特征需要处理,那么就参数数量而言,您的网络相当大。
根据我的观察,上面有几个参数需要处理,所以它在 GPU 中需要很多时间
根据我的个人经验:
我曾经用 CNN 算法训练一些图像以在 GPU 和 CPU 中进行预测 CPU 在完整数据集上生成训练模型的处理时间很短,但 GPU 需要更多
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