微信公众号搜"智元新知"关注
微信扫一扫可直接关注哦!

pystan 贝叶斯推理的软件包

程序名称:pystan

授权协议: GPL

操作系统: 跨平台

开发语言: Python

pystan 介绍

pystan 为 Stan 提供了一个 Python 接口,这是一个使用 No-U-Turn 采样器进行贝叶斯推理的软件包,这是Hamiltonian
Monte Carlo 的一种变体。

pystan具有以下依赖项:

  • Python:2.7,> = 3.3

  • Cython:> = 0.22

  • NumPy:> = 1.7

pystan还要求在安装和运行时可以使用C ++编译器。 在基于Debian的系统上,这是通过发出命令apt-get install build-
essential来完成的。

例子:

import pystan

schools_code = """
data {
    int<lower=0> J; // number of schools
    vector[J] y; // estimated treatment effects
    vector<lower=0>[J] sigma; // s.e. of effect estimates
}
parameters {
    real mu;
    real<lower=0> tau;
    vector[J] eta;
}
transformed parameters {
    vector[J] theta;
    theta = mu + tau * eta;
}
model {
    eta ~ normal(0, 1);
    y ~ normal(theta, sigma);
}
"""

schools_dat = {'J': 8,
               'y': [28,  8, -3,  7, -1,  1, 18, 12],
               'sigma': [15, 10, 16, 11,  9, 11, 10, 18]}

sm = pystan.StanModel(model_code=schools_code)
fit = sm.sampling(data=schools_dat, iter=1000, chains=4)

pystan 官网

https://github.com/stan-dev/pystan

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。

相关推荐