pystan 介绍
pystan 为 Stan 提供了一个 Python 接口,这是一个使用 No-U-Turn 采样器进行贝叶斯推理的软件包,这是Hamiltonian
Monte Carlo 的一种变体。
pystan具有以下依赖项:
-
Python:2.7,> = 3.3
-
Cython:> = 0.22
-
NumPy:> = 1.7
pystan还要求在安装和运行时可以使用C ++编译器。 在基于Debian的系统上,这是通过发出命令apt-get install build-
essential来完成的。
例子:
import pystan schools_code = """ data { int<lower=0> J; // number of schools vector[J] y; // estimated treatment effects vector<lower=0>[J] sigma; // s.e. of effect estimates } parameters { real mu; real<lower=0> tau; vector[J] eta; } transformed parameters { vector[J] theta; theta = mu + tau * eta; } model { eta ~ normal(0, 1); y ~ normal(theta, sigma); } """ schools_dat = {'J': 8, 'y': [28, 8, -3, 7, -1, 1, 18, 12], 'sigma': [15, 10, 16, 11, 9, 11, 10, 18]} sm = pystan.StanModel(model_code=schools_code) fit = sm.sampling(data=schools_dat, iter=1000, chains=4)
pystan 官网
https://github.com/stan-dev/pystan
版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。