这篇文章给大家分享的是有关AmiGO2工具有什么用的内容。小编觉得挺实用的，因此分享给大家做个参考，一起跟随小编过来看看吧。
GO数据库的信息是非常庞大的，为了有效的检索和浏览GO数据库的信息，官方提供了AmiGO, 可以方便的浏览，查询和下载对应信息，官网如下
http://amigo.geneontology.org/amigo/landing
broswer功能，采用树状结构，提供了GO的层级分类信息，示意图如下
鼠标单击某个对应的分类，会弹出如下对话框
点击Term的链接，可以查看该层级下，所有的Gene Ontology 信息，而且可以下载，示意图如下
Annotations
Ontology
-
Genes and gene products
1. Annotations
通过
Download按钮可以下载数据。
2. Ontology
目前共有44997个Go Tems, 在页面右侧的菜单栏，可以根据Ontology source和SubSet进行筛选。
Ontology source 指的是GO的三大类型，通过+将对应的条件添加到筛选条件中，目前，BP共有29682个Go Tems;MF共有11120个GO Terms;CC 共有4195个Go Tems。
Subset 代表Go slim, 指的是Go 数据库的子集，可以根据研究物种的范围筛选合适的Go skim。
筛选完成后，可以通过Custom DL下载对应结果，一次最多下载100000条记录。点击下载按钮，首先选择需要下载的列，这里我选择如下3列
得到的数据如下
GO:0015009 corrin Metabolic process biological_process GO:0015010 tetrahydrocorphin Metabolic process biological_process
第一列GO编号，第二列描述信息，第三列分类，通过这种方式可以方便的得到所有Go Terms的信息。
3. Genes and gene products
除了以上基本功能外，AmiGO2 还提供了很多实用的小工具，比如Visuzlize功能，可视化的展示某个Go Terms 在整个GO 数据库中的位置。
在输入框输入GO编号就行了，示意结果如下
会画出输入的Go Terms到根节点的结构，更多的功能请移步官网。
感谢各位的阅读！关于“AmiGO2工具有什么用”这篇文章就分享到这里了，希望以上内容可以对大家有一定的帮助，让大家可以学到更多知识，如果觉得文章不错，可以把它分享出去让更多的人看到吧！
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