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bioconductor
bioconductor专题提供bioconductor的最新资讯内容,帮你更好的了解bioconductor。
如何解决表明 sce 不是数字的 addPerCellQC 错误?
我从事 R 分析单细胞 RNA seq 数据。我目前正在尝试将 QC 数据添加到我的 SingleCellExperiment (sce) 对象中; mi
作者:佚名 时间:2022-05-24
使用 DESeq2 'contrast' 和 'relevel' 分析三种条件下的数据
我是 RNA-Seq 的新手,目前正在分析我的实验数据。我有一个关于使用 relevel 的问题。 我的实验条件
作者:佚名 时间:2022-05-24
无法在 R 上运行 Deseq2 脚本
我正在尝试对批量 RNA 数据运行 Deseq2 程序。我在 Windows 7 x64,R v4 上 我运行这个: <pre><code>dds &l
作者:佚名 时间:2022-05-23
确定在火山图上过滤了哪些 RNA SEQ 数据
我正在使用 RNA seq 数据通过 R 中的火山图(比较使用和不使用抗生素的细菌的差异基因表达)来分析基
作者:佚名 时间:2022-05-23
错误:Bioconductor 版本“3.13”需要 R 版本“4.1”R 版本 4.0.2
我从其他用户那里找到了“类似”的问题,但没有一个答案奏效。我正在尝试安装这些软件包: <pre><
作者:佚名 时间:2022-05-23
错误:我的 bioconductor 不是 3.12 版吗?
我已经重新安装了 R 4.0.3。我需要兼容的 Bioconductor 3.12。我相信我已经拥有了,当我这样做时: <pre><c
作者:佚名 时间:2022-05-22
错误:“命名空间:ff”未导出对象“克隆”
我正在尝试通过 biocmanager 安装 R 包 我使用的命令是 <pre><code>> BiocManager::install("oligo") E
作者:佚名 时间:2022-05-22
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
我想知道仅chr1上1Mb区域的基因密度分布,正负链上的基因数量,以及正负链上有多少基因重叠。我正在
作者:佚名 时间:2022-05-20
为什么我收到错误消息“mapIds(GeneCol) 中的错误:找不到函数“mapIds””
我正在尝试使用大量 Gene Symbol 获取 Entrez ID。为此,我使用了“AnnotationDbi”、“org.Hs.eg.db”和“org_pkg”
作者:佚名 时间:2022-05-18
如何根据原始输入文件与python/pandas相交合并文件以将重叠划分为子区域?
我有一些来自提供外显子组测序套件的不同公司的 .bed 文件。 我想要一个文件来总结所有这些试剂
作者:佚名 时间:2022-05-17
为什么函数 plotSex 在编织时有错误?
我尝试重新创建 URL 中的最后一个数字,但得到了。一个错误。 h(simpleError(msg, call)) 中的错误:在
作者:佚名 时间:2022-05-17
在 ggcyto 图上设置 x 限制似乎没有用
我正在尝试在 ggcyto(ggplot2) 图上设置 x 限制,但它似乎不起作用。我设置的 x 限制一直向右压缩,并且有
作者:佚名 时间:2022-05-17
读取 LSR 文件以获取原始数据 (R)
我正在尝试从 Array Express (E-GEOD-32992) 读取数据集。我发现原始数据在一种与 CEL 不同的文件类型中的问题
作者:佚名 时间:2022-05-17
使用 Bioconductor 构建 ExpressionSet 时出错
我正在尝试制作用于分析 RNA-seq 数据的 ExpressionSet 文件。我只有一个称为“exprs”的计数矩阵,一个称为
作者:佚名 时间:2022-05-15
在R中下载omu包
我想下载用于在 R 中进行代谢组学分析的“omu”包,但在我下载后它不断弹出相同的错误 <pre><code>User
作者:佚名 时间:2022-05-14
错误:对象和替换值具有不同的维度
[在此处输入图片描述][1]我是一名正在学习如何进行微阵列分析的学生。我遇到了以下错误,希望有人指
作者:佚名 时间:2022-05-14
如何使用 Windows 在 R 版本 3.6.1 上安装 ReportingTools 包
我对 R 非常陌生。我在安装生成良好 HMTL 报告所需的“报告工具”包时遇到问题。我正在使用使用 R 版
作者:佚名 时间:2022-05-14
无法在 R 4.0.1 上下载 Bioconductor 的“org.Hs.eg.db”包
我正在尝试安装 Bioconductor(版本 3.12)包“org.Hs.eg.db”,但我一直收到以下错误: <pre><code>Error: packag
作者:佚名 时间:2022-05-14
MetaVolcanoR:错误:FUN(X[[i]], ...) 中的错误:未找到对象“法规”
我在使用 <strong>MetaVolcano</strong> R 包时遇到以下错误。 错误 1: <pre><code>meta_degs_vote <- votecount_
作者:佚名 时间:2022-05-12
我如何告诉 R 包 Limma 在 read.idat() 中使用什么作为“目标”?
我正在分析一些微阵列数据。对于每个捐赠者,我都有一个“干预前”和“干预后”的 idat 文件。我已
作者:佚名 时间:2022-05-12
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