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bioinformatics
bioinformatics专题提供bioinformatics的最新资讯内容,帮你更好的了解bioinformatics。
我是 Linux 新手,我正在尝试激活“模块加载 python2 samtools rseqc”,但我遇到了 Lmod 版本问题
我一直收到这个错误; <pre><code>ERROR: rseqc/3.0.0 requires several additional modules. Run the following commands to load
作者:佚名 时间:2022-05-22
并行 BLAST 程序耗时太长
当我运行以下代码时,我什至没有得到一个爆炸结果。有人可以让我知道他们是否发现了错误? <pre><
作者:佚名 时间:2022-05-22
随机更改python列表中的字符
我有这样的python代码生成的序列: <块引用> TTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
作者:佚名 时间:2022-05-22
如何在 Nextflow 中调用脚本中创建的变量?
我有一个从文本文件创建变量的 nextflow 脚本,我需要将该变量的值传递给命令行命令(这是一个 bioconda
作者:佚名 时间:2022-05-22
使用 fasta 文件中的序列 ID 提取序列
我有一个 fasta ID(示例中为 <code>Q99424</code>),我需要提取该 ID 的相应序列。我正在使用 <code>Bio</code>
作者:佚名 时间:2022-05-21
如何使用 Python3 中的 biopython 库从 TB 测序 fasta 文件中找到反向基因如 pncA的突变?
要找到类似 S104R 的突变(吡嗪酰胺从 2288681 到 2289241),我们必须首先删除“-”(用于剥离 fasta 文件中
作者:佚名 时间:2022-05-21
使用 GSEAPY 进行富集分析
我正在尝试使用 gseapy 富集器对如下所示的基因名称列表运行富集分析: <pre><code>0 RAB4B 1 TIGAR 2
作者:佚名 时间:2022-05-18
查找两个文本文件的差异
我有两个单独的文件 <code>A</code> 和 <code>B</code>,超过 100000 行。现在我需要比较每一行以找出它们是否
作者:佚名 时间:2022-05-19
R 版本 4.0.4 中的匹配函数
我有 2 个大型数据集。一种是<strong>DB</strong>作为数据库,一种是<strong>原始</strong>用于我自己的数据:</
作者:佚名 时间:2022-05-20
R中的基因组坐标
我正在处理 <a href="https://bioconductor.org/packages/release/data/annotation/html/TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene.html" rel="nofo
作者:佚名 时间:2022-05-20
matplotlib |在条形图上方绘制值
我有想要在两个条形图上方绘制的值。 我确信这很容易,但我无法让我的 <code># Values</code> for 循环
作者:佚名 时间:2022-05-20
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
我想知道仅chr1上1Mb区域的基因密度分布,正负链上的基因数量,以及正负链上有多少基因重叠。我正在
作者:佚名 时间:2022-05-20
带有`snakemake`的MD任务
我想为分子动力学模拟创建一个非常简单的管道。程序(Amber)只需要 3 个文件作为输入,并生成了很多
作者:佚名 时间:2022-05-20
获取与搜索查询列表匹配的绝对出版物数量
也许有人知道如何获得标题或摘要与每个解析的搜索查询匹配的出版物的绝对数量,例如: <ul> <li>EGF
作者:佚名 时间:2022-05-18
如何自动查找列表的值是否存在于 R 的另一列数据框中
在现有的 csv 中,有一列包含以下代码之一,即每一行的外膜 [GO:0019867]。我想在 csv 中添加一列,该列将
作者:佚名 时间:2022-05-18
如何一次对多个变量进行方差分析并将结果保存在 R 中的数据框
我处理了大量数据,420 个样本分为 5 个组和 5700 个变量。我想对每个变量执行方差分析,从这样的表开
作者:佚名 时间:2022-05-18
在我的情况下,是否可以用更快的东西例如应用替换 iterrows ?
所以我有一个如下所示的表格: <div class="s-table-container"> <table class="s-table"> <头> <tr> <th>0</th> <th>1</th> <
作者:佚名 时间:2022-05-18
cgmaptools 类型错误:序列项 0:预期的 str 实例,找到的字节数
我正在使用 cgmaptools 工具中的 python 脚本进行生物信息学分析,但出现以下错误消息: 文件“/.../bi
作者:佚名 时间:2022-05-18
将美学“x”从字符转换为 R 中的列表类型
我的数据的前几行看起来像这样 <pre><code>GO.ID Term Annotated Significant Expected raw.p.value GO:006
作者:佚名 时间:2022-05-18
为什么我收到错误消息“mapIds(GeneCol) 中的错误:找不到函数“mapIds””
我正在尝试使用大量 Gene Symbol 获取 Entrez ID。为此,我使用了“AnnotationDbi”、“org.Hs.eg.db”和“org_pkg”
作者:佚名 时间:2022-05-18
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