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bioinformatics
bioinformatics专题提供bioinformatics的最新资讯内容,帮你更好的了解bioinformatics。
浏览器搜索与Bio.entrez搜索的结果不同
使用Bio Entrez进行搜索时,得到的结果有所不同。例如,当我在浏览器上使用查询“ covid side effect”搜索
作者:佚名 时间:2022-06-07
如何按升序对我最常用的3聚体列表进行排序?
我正在编写代码,以找出DNA序列中最常见的3聚体。我编写了一个代码,计算一个3字符的出现次数,如果
作者:佚名 时间:2022-06-07
非法指令:运行SignalP-5时为4
我正在尝试使用SignalP来预测从转录组预测的蛋白质的蛋白质裂解,但是当我在终端中本地运行程序时,
作者:佚名 时间:2022-06-07
如何获取100个样本,每个样本的长度为1000个5位单体的比例,即AATAA
我对R陌生。请您能帮忙吗? 我需要计算作为AATAA的5个单体的样品比例的平均值。但要从NC_006620.3的
作者:佚名 时间:2022-06-06
关于作物遗传多样性研究的数据库和软件类型的咨询
对于一个研究项目,我正在评估罗布斯塔咖啡遗传资源在非洲热带地区的潜力。将对不同的异位遗传系
作者:佚名 时间:2022-06-06
利用临床参数和基因表达数据将基因表达聚类到R中特定的乳腺癌亚型
我有一组来自3种不同亚型的乳腺癌样品及其临床参数的1500个基因的基因表达值。我需要根据乳腺癌亚型对
作者:佚名 时间:2022-06-06
如何将Fasta字符串分成多个行,以保证r中未更改的列数?
我正在尝试读取fasta文件,并将序列作为单独的氨基酸显示为数据框。 1 seq = 1列 这是到目前为止我
作者:佚名 时间:2022-06-06
当anyis.nacounts= FALSE时,DESeq2“不允许使用NA值”错误
我有一个包含NA值的计数矩阵。 我使用设置它们为0 <pre><code>counts[is.na(counts)] <- 0 </code></pre> <p
作者:佚名 时间:2022-06-06
替代awk的python吗?
我有两个fasta文件,我想搜索序列ID,并仅将与ID对应的序列分配给Python中的字符串。 我目前有:</p
作者:佚名 时间:2022-06-05
从Fasta文件中提取映射的配对末端读
我有10个样本,可以得到配对的末端读数: <pre><code> file1_R1.fq (mate 1) file1_R2.fq (mate 2) ... file10_
作者:佚名 时间:2022-06-05
在与SLURM进行交互式会话时,如何在我的双消化,双末端Illumina NovaSeq数据中使用Stacks process_radtags?
我想使用Stacks process_radtags开始分离合并的DNA样本,以便对Cassin's Sparrow进行亲子鉴定。我是通过哈佛大学
作者:佚名 时间:2022-06-04
基因蛋白质序列数据库
我想知道是否有办法从NCBI下载或检索基因的所有蛋白质序列。我有很多GeneID想要迭代并检索其蛋白质序
作者:佚名 时间:2022-06-04
使用GDC客户端工具套件将TCGA数据降级时出错
我正在尝试从TCGA中获取> 1000个文件的临床数据。我已经使用了GDC客户端工具套件 但它显示以下错误。</p
作者:佚名 时间:2022-06-04
R?中的去趋势典范对应分析
是否可以在R中执行去趋势的典范对应分析?我希望分析生态(花粉)数据,以研究随时间变化的β多样
作者:佚名 时间:2022-06-04
Bio.Alphabet _verify_alphabet函数现在位于哪里?
由于<code>Bio.Alphabet</code> <a href="https://biopython.org/wiki/Alphabet" rel="nofollow noreferrer">recently</a>已在<code>Bio.Seq</
作者:佚名 时间:2022-06-04
解释似然性Watterson theta
我是第一次计算Watterson theta,我正在使用<a href="https://github.com/ANGSD/angsd" rel="nofollow noreferrer">ANGSD</a>。据
作者:佚名 时间:2022-06-04
从FASTA格式的文件中写入单个序列
给出FASTA格式的文件(您的文件),例如: <pre><code>>Code1234_length1 ABCEDLKSDJFABCEDLKSDJFABCEDLKSDJFABCEDLKSDJF
作者:佚名 时间:2022-06-04
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我有一个遗传数据集,其中我将基因组中物理上紧密靠近的基因变体分组。我将每个染色体上与基因组
作者:佚名 时间:2022-06-03
寻找python函数以找到字符串中最长的顺序重复的子字符串
我正在对DNA序列进行一些编码,并且我对寻找顺序重复的功能感兴趣(这可能表示引物可以“打滑” AKA
作者:佚名 时间:2022-06-03
尝试运行RDAVIDWebService
我正在尝试运行RDAVIDWebService: <pre><code>library("RDAVIDWebService") e_mail <- 'myemail.org' david<-
作者:佚名 时间:2022-06-03
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