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bioinformatics
bioinformatics专题提供bioinformatics的最新资讯内容,帮你更好的了解bioinformatics。
从后验平均基因型计算等位基因频率
在以下文件(input_file.txt)中: <pre><code>col1, col2, col3, NA, NA, NA, NA, 0, 0.1, 0, 0.002, 1, 0, NA, NA, NA, 1, 1.9, 0,
作者:佚名 时间:2022-05-27
如何绘制蛋白质结构的自由能图谱?
我知道这个问题不适合这个平台,但如果我能得到一些提示,我可以试试, 我一直在尝试绘制蛋白
作者:佚名 时间:2022-05-27
python中使用subprocess.run()运行samtools的问题
我正在使用 subprocesss.run() 在 python 中运行 samtools 命令。代码如下: <pre><code>result = subprocess.run(['sam
作者:佚名 时间:2022-05-26
如何处理snakemake中的python版本/包冲突?
我正在尝试使用 snakemake 构建管道。我创建了一个使用 python v3.9 的 conda 环境,还包含了 snakemake 程序。
作者:佚名 时间:2022-05-26
同步pymol
我正在尝试加载一个mrc文件,生成它的地图然后保存图像,问题是它只保存了一个空白图像,我运行的
作者:佚名 时间:2022-05-26
对齐数据集
我在 excel 中工作,并且有许多包含基因和相应表达值的文件。不同的文件(不同的样本)以不同的顺序
作者:佚名 时间:2022-05-26
从 unix 中的 fasta 文件中消除不完整的基因
我有一个类似以下内容的 fasta 文件(为简单起见缩短了氨基酸序列): <pre><code>eval(parse('filename.r&
作者:佚名 时间:2022-05-26
特定空间模式中的细胞集落存活映射
我正在尝试在给定的细胞瓶扫描图像中绘制细胞存活的空间图。快速背景:细胞接受了通过网格传递的
作者:佚名 时间:2022-05-26
Python 数据整理帮助:根据行中的字段过滤数据并转换列表
我是编码新手,用它来对病毒样本进行生物信息学。我有一个我没有编写的 Python 脚本的输出文件(它执
作者:佚名 时间:2022-05-26
循环字典以创建多个列表/字符串
我有一本看起来像这样的字典: <pre><code>a = { (1, 'M'): 0.106997, (2, 'R'): 0.167087, (3, &
作者:佚名 时间:2022-05-26
如何在ggplot中设置选择文本的位置?
我有一个由名为 REVIGO 的网络工具提供的脚本创建的图。它给出了生物学术语的图以及它们如何相互重叠
作者:佚名 时间:2022-05-25
序列搜索期间的正则表达式错误
提前致谢, 我正在尝试从 NCBI 中提取作为分类群 ID 的代码的最后几位数字。我想要这个标签中的粗体数
作者:佚名 时间:2022-05-25
如何通过基因 ID 从 Fasta 文件中检索序列
我知道这个问题已经被问了一百次了,但我一整天都在问这个问题,我似乎无法解决这个问题。 我有一
作者:佚名 时间:2022-05-25
从 R 中的“dgCMatrix”类稀疏矩阵中删除行
我是一名生物信息学学生,对 R 相当陌生。我正在使用类“dgCMatrix”的稀疏矩阵,我想找到一种方法来
作者:佚名 时间:2022-05-25
无法使用 read.metharray.exp() 读入 IDAT 文件
我想进行甲基化数据分析,我也是初学者,我有 450K 和 EPIC 的数据。我创建了一个包含哨兵 ID、哨兵位
作者:佚名 时间:2022-05-25
使用 GCC 编译时出现问题
您好! 对不起,如果这是重复的,但我已经在网上搜索并没有找到解决方案。 我正在尝试使用 make 编译
作者:佚名 时间:2022-05-25
如何在脚本中更改蛇形.输入/蛇形.输出的对象类型以创建目录?
我正在尝试使用以下规则从 snakemake 中使用 python 脚本 <pre><code>rule split_cells: input: base_path + "{samp
作者:佚名 时间:2022-05-25
如何遍历数据矩阵并计算选定的行? 数据
我有以下称为 matrix1 的数据矩阵: <pre><code> [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] A 1 1 4 1 19 15 C 2 1
作者:佚名 时间:2022-05-24
在 R 中重新排序数据帧
我认为这将是一个简单的问题,但直到现在我才找到答案。我有一个位置开始和位置结束的数据框,如
作者:佚名 时间:2022-05-24
AME包在CONDA环境下找不到模板
我在 SLURM 服务器上使用 Conda (4.5.4) 下 MEME-Suite 包中的 AME 软件。 使用 AME 时,我收到以下错误消息:
作者:佚名 时间:2022-05-24
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