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我将一些用于Sanger测序的样品发送给商业机构。我能够使用命令读取它们发送的文件 <pre><code>from Bio i
我正在尝试使用Python解析pdb文件(蛋白质数据库)。 文件中的此类行引起了麻烦: <strong> ATO
我在这个问题上停留了一段时间,尽管我发现了各种各样类似的问题,但都没有完全适合我的问题或解
我需要将聚合物的PDB移动到蛋白质附近。我已经使用Biopython尝试了以下代码, <pre><code>import numpy import
我想要一个函数来读取具有DNA序列(可能是模棱两可)的FASTA文件,并输入一个子序列,该子序列返回包
我遇到了一个问题,即它不能将所有G替换为C,而不能将C替换为G,我该怎么办才能解决此问题? 我现在
目前,我正在使用Biopython的Esearch来获取搜索词的论文列表。 不幸的是,当我将它们与网络搜索结果(<a
以下代码导致此错误: <pre><code>Traceback (most recent call last): File &#34;/t.py&#34;, line 19, in &lt;module&gt; s
我希望从fasta头文件中获取生物体名称,我感兴趣的是从描述中提取<em> OS =(Organism Name)</em> </em>时的生
我在Biopyhton遇到了麻烦。我用这段代码下载了一组蛋白质 <pre><code>from Bio.PDB import * from biopandas.pdb impor
我刚购买了MacBook Pro,并且python的预装版本是2.7.x,并且我试图安装<code>biopython</code>,但需要python 3.6及
我有一个蛋白质ID列表,我正在尝试使用python从Uniprot访问蛋白质序列。 我碰到了这篇文章:<a href="https:/
我需要从PDB中以<code>cif</code>格式从结构文件中提取单链。我已经阅读了几个相关的问题,例如<a href="http
我目前正在分析由蛋白质袋和配体分子组成的PDB文件。 每个配体的残基名称设置为“ UNL”,PDB文件如下
我找不到scikit-learn的方法,无法在K-Means上使用相关距离度量-这对于我的基因表达数据集来说是必需的。
我需要将列表的每四个项目另存为python中的键,然后从第四个项目每5个开始作为值,并从第四个项目每6
我有一个带有一些参考基因组的fasta文件。 我想根据染色体,起始索引和终止索引以字符串形式获取参
我有两个文件:<em> human.fa </em>和<em> protein-coding_gene.txt </em>(有数百种不同的蛋白质信息)。我必须先解
当我<code>import Bio</code>在Mac上的Anaconda的Jupyter笔记本中时,出现此错误:<code>No module named &#39;Bio&#39;</code>。
我正在使用以下代码从DNA序列的fasta文件中更改fasta名称。我将序列数设置为原始fasta文件中的全部序列