我有一些基因序列。我试图在NCBI中进行手动爆炸，这需要很多时间（<a href="https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.
<pre><code>from Bio.Blast.Applications import NcbiblastpCommandline
blastp_cline = NcbiblastpCommandline(cmd="~ncbi-blast.2.10.1+bin/bl
<pre><code>import sys
sys.path.append('/home/minhlam/ncbi-blast-2.10.1+/bin/db')
makeblastdb -in human.fa -db mouse.fa -out mousedb
我们正在尝试使用 BLAST API 输入 FASTA 序列，并通过他们的算法为我们正在进行的项目获取百分比标识。
我正在离线使用blast 来对齐fasta 文件。我使用了一个名为“ref.fasta”的参考数据库和我想在其上运行blast
使用 -in_msa 选项时 psiblast 出错
运行此代码：
<pre><code>module load BLAST+/2.11.0-foss-2020b
psiblast -in_msa $MSA -d
当我运行以下代码时，我什至没有得到一个爆炸结果。有人可以让我知道他们是否发现了错误？
<pre><
我正在尝试使用以下命令运行 psiblast：
<code>$ psiblast -comp_based_stats 1 -evalue 0.001 -num_iterations 3 -db $dbn
我想从四个文库的公开可用 SRA 数据中重新组装真核基因组：两个配对末端和两个配对配对，全部使用 Il
我查看并找到了解决方案，尝试了它们并得到了相同的结果。我尝试使用 <code>Popen.wait()</code>、<code>run()<
我需要帮助以多 Fasta 格式提取序列或将单个 Fasta 格式转换为多 Fasta 格式。我已经设法从我的 BLAST 搜索
Ctrl+F（MacOS 上的 Cmd+F）是用于在文档中查找字符串实例的标准键盘快捷键。我最近一直在非常大的文档
我想使用<strong>BLAST</strong>等算法在<strong>本地</strong>数据库中<strong>存储</strong>和<strong>搜索</strong>长DNA
我正在尝试使用核苷酸序列进行 BLAST 搜索并打印最佳匹配结果，但不确定应该使用哪个选项/命令。有 <c
我正在尝试使用 Java 从内存中获取执行 BLAST（基本局部对齐搜索工具）查询的结果。我目前正在从 Java
我是 Pycharm 的新手，我发现很难浏览。我想知道我是否可以在 Pycharm 中下载blast，或者是否有办法查看bla
我正在尝试运行 qblast() 函数，但运行时间很长。
<pre><code>from Bio.Blast import NCBIWWW
result_handle = NCBIWWW.qbl
我写了一个 Biopython 脚本，它给了我结果，我有一个这样的文件：
<pre><code>>NW_020169394.1_41 [10497-10619]
<strong>编辑：回到数据上，我刚刚意识到发生了什么。 Python 将重复项的第一个实例视为唯一序列，其余
我试图只从NCBI xml BLAST文件中提取第一个命中.接下来我想获得第一个HSP.在最后阶段,我想根据最高分获得这些. 在这里清楚地说明xml文件的一个示例： <?xml version="1.0"?>
<!DOCTYPE BlastOutput PUBLIC "-//NCBI//NCBI BlastOutput/EN" "http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dtd/NC
