提供给我的perl脚本包含：
<pre><code>use strict;
open(IN1, "<".$ARGV[0]);
open(IN2, "<".$ARGV[1]);
op
我已经将一个较大的fastq文件拆分为6个或7个较小的，更易于管理的文件，用于基因组组装。
现在
编码新手；背景是微生物生物信息学。我正在尝试运行 cutadapt 来过滤我的碱基对读取，但它不会过滤任
<pre><code>├── DIR1
│ ├── smp1.fastq.gz
│ ├── smp1_fastqc/
│ ├── smp2.fastq.gz
│ └── smp2_fast
我需要将FASTQ文件读取到AWS Glue作业脚本中，但出现此错误：
跟踪（最近一次通话最近）：文件“ /
我正在处理条形码数据，我希望能够合并fastq文件，并能够轻松分辨出读取的原始条形码。所以我试图将
这是我第一次进行比对，我需要一些帮助来确定哪种对准器最适合我的情况。
我正在尝试对齐先前
我有一个大小约为80GB的fastq文件（<code>file.fastq</code>），其中有一个标题行和三个后续的信息行。我需要
我下面有一个fastq文件，我想用<code>lane=$2</code>分割文件。我的代码完成了拆分工作，但我还希望输出文
我有一个 Python 脚本 <code>heavy_lifting.py</code>，我使用从 bash 包装器脚本 <code>wrapper.sh</code> 调用的 GNU Parall
所以我正在编写这段代码来读取 fasta 文件。在 fasta 文件中，将有 10 个序列。序列的开始将是 ">" 我想拆
这是一个非常初级的问题，所以提前致谢。
我得到了一个 R 脚本来将 fastq 文件与基因组对齐。我
以下是我拥有的以逗号分隔的 FASTQ 读取 ID 列表。我想知道如何从我的 fastq 文件中提取这些读取。你能
我有许多 fastq.gz 格式的 Illumina 序列样本，我想将它们转换为 fasta 文件，但我不知道从哪里开始。任何
我在 bash 中使用 cat+pipe+parallel 编写了一个简单的脚本，但由于大量输入数据（>200），我的计算机崩溃了
我想在 win 10 上安装 SRA 工具包并将例如 SRR066194.3 转换为 fastq 格式。但第一步遇到这个错误：
<块引
我有一个管道的 GitHub 存储库，需要非常大的文件作为输入（基本测试数据集大约为 1-2 Gb）。
我想
我正在尝试使用 sed 命令重命名 fastq 标头并在 fastq 标头的末尾添加“/1”。
这是我的代码：
<pre><code>
我需要计算包含字符串“TAACCCTAACCCTAACCCTAACCC”的双端fastq文件的百分比。
所以我用了 bbduk.sh in1=1.fastq.gz i
更新：主题 FTP 服务器已停用：[讨论] (<a href="https://github.com/ewels/sra-explorer/issues/14" rel="nofollow noreferrer">ht
