我正在使用gmap gsnap版本2020-06-30。尽管alignment命令运行良好，但是get-genome命令未提供任何输出。也没有
我使用以下代码将52G fastq文件拆分为10G块：
<pre><code>split -b 10G /home/bilalm/H_glaber_quality_filtering/AfterQC/goo
我正在研究使用霍夫曼编码的变体的基因组压缩算法。我在python2中有以下代码：
<pre><code>def makeHuffTree(t
我正在创建一个Snakemake工作流程，它将包装一些<a href="https://www.nvidia.com/en-us/docs/parabricks/quickstart-guide/sof
我已经将一个较大的fastq文件拆分为6个或7个较小的，更易于管理的文件，用于基因组组装。
现在
我正在尝试使用HAIL解析以.bgen格式传送到Spark DF的基因组数据。该文件的大小为150 GB，无法放入群集中的
例如，我有一个这样的文件。如何计算连续N个跨行出现的次数？
<pre><code>NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
该文件约为45 GB，以“ .gds”（基因组数据结构（GDS）文件）结尾。
如何将其读入rstudio和aws，以便我可
我正在尝试为我的snRNA数据创建前mRNA参考。这是我的命令
<pre><code>cellranger mkref --genome=mm10-2020-A_premrna
我刚刚开始学习linux CLI。我正在使用snippy工具比较需要.tab格式文件的多个文件。此制表符格式的文件应
我正在寻找帮助，以计算沿染色体每个区域的人类基因组hg38的核苷酸背景。最好是这样的。
<blockquote>
<
我有两组来自两个不同蝙蝠物种基因组的相应同源序列，每组都在自己的fasta文件中。
例如，对于
我在python编程方面经验很少，而且我才刚刚开始学习这种脚本语言。我有一个脚本和一堆.gff基因组文件
我有一个2层神经网络，我正在针对大约10000个特征（基因组数据）进行训练，数据集中包含大约100个样
我正在训练一个卷积神经网络，并且看到我的验证精度波动很大的问题。我也看到了一些关于培训准确
此功能predORF出现问题
<pre><code> sqa <- c("CAGGGCACCTGGCCTTGGGATGCGCCTCCTGCCCGCTGAGCCCAGGGGCCGCTATGGCCCTTCTGGCCATGCTG
我目前处于我的 RNA-seq 工作流程的阶段，其中涉及使用对齐工具，为此我选择了 STAR（这是通过 SSH puTTY
这听起来有点愚蠢，但我是 R 的新手，我需要根据我获得的一些 DE-Seq 数据制作 MA Plot。
这是一些
我想比较几个国家的细菌基因组样本中的一些基因组特征。有人知道如何从我选择的地方下载所有 gbk 的
我正在尝试制作一种算法来解决基因组组装问题。这是我的步骤：
<ol>
<li>构建重叠图：通过最长的重
