尊敬的堆栈溢出社区，
我想问您有关我的问题的帮助。我正在使用ggtree软件包绘制系统发育树，我
我正在尝试使用ggtree函数gheatmap将热图添加到系统树上。尽管创建gheatmap对象的行中没有出现明显的错误
我正在使用R包ggtree绘制R中的系统发育树。
我成功地制作了我感兴趣的系统发育树，但是，在给人
我想用斜体表示A，而正常用CBS。
我认为ggtext可能有用，但出现错误。
这是一个例子：
<pre><code>func bu
我知道我可以通过如下组合尖端标签来设置尖端颜色：
<pre><code>library(ggtree)
tree<-read.tree(text="(A,(
如何根据样本所属的类别为树的尖端着色？
<pre><code>nwk <- system.file("extdata", "sample.nwk", p
我想结合ggtree生成的p和基于dat的直方图。系统发育树和直方图都有相同的条目，但是我观察到的唯一一
我试图在树的顶端用饼图制作系统发育树，但是我真的对如何做到这一点感到困惑。
这是一个简单
我试图按照<a href="http://yulab-smu.top/treedata-book/chapter5.html#uncertainty-of-evolutionary-inference" rel="nofollow noreferrer"
我想显示图例但它不会显示。我正在绘制如下所示的树，但代码没有显示图例。当我设置休息时会出现
我试图从一个图中删除 x 轴（左侧的树应该没有 x 轴标签、刻度、线等），同时将 x 轴保留在右侧的图
我根据表型特征制作了一棵树，例如：
物种1 2102102
物种2 1101210，
其中数字是特征的表示。我计算了汉
我一直在尝试使用 R 中的 <code>ggtree</code> 包绘制带有颜色编码分支和尖端的树。以下是使用 <em>Anolis</em>
我正在尝试使用 RevGadgets 1.0.0 和 ggtree 2.4.2 绘制在 RevBayes 中生成的祖先状态树。调用如下，所有变量都
我尝试使用命令 >BiocManager::install("ggtree") 安装 ggtree，但最终出现错误 >安装路径不可写，无法更新包
路
我正在用 ggtree 和 gheatmap 创建一棵树。我正在尝试解决如何去除尖端瓷砖之间的空间和/或合并具有相同
我正在尝试使用 ggtree 绘制一棵大树，但是由于它的大小，我想折叠多个节点。我正在学习一个教程，但
我的编码经验非常有限，所以请耐心等待！
我有一个 newick 树和一个 .txt 文件，其中包含分配给不
我正在尝试创建一个系统发育树，为不同的背部模式显示不同颜色的尖端点，当我几周前第一次尝试时
我将我的树以 nwk 格式导入 R。
我能够按照 <a href="https://guangchuangyu.github.io/software/ggtree/faq/" rel="nofol
