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我尝试在Nextflow管道中使用后缀“ .js”压缩文件。 我的问题是,'result.tar.gz'存档仅包含指向原始文件的
我通过conda下载了一个名为“ beagle”的Java软件(已经安装了<strong> java-jdk </strong>和<strong> java </strong>)
我已经用Nextflow实现了一些NGS数据分析工作流。在某些工作流程中,我使用了“配对结束”通道(fromFileP
我是nextflow的新手。我们想使用nextflow构建工作流,并让nextflow将工作流部署到我们使用的大型多机构Kuber
我正在尝试弄清楚如何检查频道是否为空。 例如,我有两个过程。只有在设置了参数/标志的组合
我们正在尝试在非默认的k8s命名空间上使用nextflow,我们使用的命名空间为<code>nextflownamespace</code>。我们
我在Nextflow中使用Python脚本遇到问题,我的目标是在python脚本中编写一个文件,然后在nextflow中使用它,
我试图让一个仅在满足条件组合的情况下启动的进程,但是当检查通道是否具有文件的路径时,它总是
我有一个类似于以下结构数据的数组: <pre class="lang-yaml prettyprint-override"><code>- name: foobar sex: male fa
我正在尝试使用nextflow从我的python脚本中获得一些并发性,因此我的某些数据流没有使用传统的nextflow理
我正在尝试学习Nextflow,并努力使这个简单的脚本在R中工作: <pre><code>echo true col=Channel.from(2,4) proces
我的数据被构造为成批运行的样本。所以我有一个这样的目录层次结构: <pre><code>/path/to/dir/batch_1/samp
我正在尝试通过 Linux 命令行对某些数据运行 nexflow 管道,但是当我这样做时,它失败了,因为它无法创
<pre><code>[Kasumi_H3K36, Kasumi_IgG, /mnt/Data/cut_and_tag/work/d0/3db2bde9eb1bdb0578073fb128bc4c/Kasumi_H3K36.no0.bedgraph] [Kasumi_JMJD1C
我刚刚为nextflow创建了一个新环境,但是当我运行脚本时,流程步骤是这样展开的: <pre><code>[warm up] e
我正在尝试输入两个通道。但是,seacr_res_ch2 有 4 个文件,bigwig_ch3 有 5 个文件,其中包含一个对照和 4
我正在尝试使用 nextflow 管道从 deeptool 执行边缘打印(bamCoverage)。当我输入 bam 文件并运行脚本时。它
我正在重新设计一个工作流程,基本上它从一个产生多个其他流程的流程开始。最初我在开始我的工作
我在 nextflow 脚本中运行两个进程(如下所示)。第一个过程是输出一些图,必须包含在第二个过程中才
考虑有三个进程,它们一个接一个地运行。第一个不能抢占,第二个可以抢占,第三个不能抢占。