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phylogeny
phylogeny专题提供phylogeny的最新资讯内容,帮你更好的了解phylogeny。
使用 tree$edge 行创建向量 数据
我想使用系统发育树的 tree$edge 行创建一个名称向量。我怎样才能构建这个向量? 示例: <pre><code>tree
作者:佚名 时间:2022-05-30
核酸词系统发育树
如果为 <em>n</em> 个核酸序列构建了一个词频表(序列 ATG 对应两个长度为 2 的词,AT 和 TG),则可以使用
作者:佚名 时间:2022-05-30
贝叶斯先生外群
我正在使用 MrBayes 构建系统发育树,并想知道如何将同一物种的多个序列指定为“外群”。我只能选择
作者:佚名 时间:2022-05-29
使用 R 包中的“ace”函数和“所有速率不同”模型时返回的无意义可能性:“猿”
我在使用“ace”函数的“所有速率不同”(ARD) 模型时遇到了一些问题。该函数似乎返回不同的错误/警告
作者:佚名 时间:2022-05-28
如何从 phyr 包中验证系统发育 glmm?
我有一个包含 30 个植物物种、6 个处理和每个 sp*trmt 组合(n=900)的 5 个重复的数据集。我测量了几个性
作者:佚名 时间:2022-05-28
圆形系统发育名称被削减
我正在尝试将系统发育放在复合图的中间。但是我没有找到合适的设置,因为顶部和底部的名称,或者
作者:佚名 时间:2022-05-26
如何从系统发育线性模型phylolm与 R 中的相互作用查看偏回归图?
我正在使用系统发育线性模型,并且我一直在使用 visreg 来绘制结果,但是有一个模型在连续变量 (y ~ x1*
作者:佚名 时间:2022-05-25
如何在系统发育方差分析中获得部分 r2 值
我正在执行多 phylolm 模型,我想为 LuzIncidente 中的每个类别获取不同的 r2 值。 Bellow 是我正在运行的函数
作者:佚名 时间:2022-05-24
if (k <= 0.8 && any(rr > (strwidth("W") * fsize/2))) rr <- rr/max(rr) * 中的错误
我正在使用 phytools 包,并尝试使用 <code>dotTree</code> 函数将额外特征的数据添加到我的系统发育树中,但
作者:佚名 时间:2022-05-22
无法安装 'shiny' 或 'bslib' 包
我正在尝试安装“phylosignal”软件包,但在安装“shiny”和“bslib”软件包时出现了一些错误。我尝试了
作者:佚名 时间:2022-05-18
有没有什么方法可以计算BioPython中两个系统发育树之间的距离?
我正在使用 BioPython 生成系统发育树。现在我想使用诸如“Robinson-Foulds Distances”之类的方法来计算两棵
作者:佚名 时间:2022-05-15
如何在 ggtree 中绘制彩色提示标签而不将其作为图例的一部分?
我一直在尝试使用 R 中的 <code>ggtree</code> 包绘制带有颜色编码分支和尖端的树。以下是使用 <em>Anolis</em>
作者:佚名 时间:2022-05-15
将长度添加到系统发育树中的标签
我希望使用 R 将我以 .ph 格式保存的系统发育树可视化。目前我已经成功地将树可视化,并且还能够使系
作者:佚名 时间:2022-05-14
主坐标分析 (PCoA) 中的复特征值
我正在分享一个与主坐标分析 (PCoA) 中的复杂特征值相关的问题。非常感谢任何帮助! <strong>目标</
作者:佚名 时间:2022-05-14
根据尖端标签对节点和尖端标签进行着色的系统发育比较
我使用 <code>cophylo</code> 中的 <code>phytools</code> 函数绘制了两个面对面的系统发育树,并希望根据它们的
作者:佚名 时间:2022-05-14
有没有办法在 RPhyr 和 MuMin 包中疏通 PGLMM_compare 模型?
我正在进行比较分析,我的响应变量是 0 或 1,因此我需要使用二项式误差分布进行系统发育校正分析。
作者:佚名 时间:2022-05-12
随着时间的推移模拟出生/死亡模型
我正在尝试使用出生死亡模型绘制一个图表,该图表将随着时间的推移显示物种数量。到目前为止,我
作者:佚名 时间:2022-05-10
使用谱系 = phylo 对象在 R 中运行 inverseA 函数时出错
我正在尝试计算系统发育相关性求和矩阵的逆(将输入 MCMCglmm)。我有一个系统发育树,最初运行如下
作者:佚名 时间:2022-05-03
从具有 0 和 1 的数据帧创建新格式
我有一个这样的数据框(1 表示存在突变,0 表示不存在) <pre><code> a b c d e mut1 1 1 1 1 1 mut2 1
作者:佚名 时间:2022-05-03
如何计算 PGLS 的 II 类错误?
我执行了一系列 PGLS(系统发育广义线性模型)并得到了负面结果。我想计算第二类错误(即使在现实生
作者:佚名 时间:2022-05-02
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