我正在使用R中的phyloseq类的bar_plot函数制作条形图。我将2个图放在一起。如何在两个图中使y轴和列大小
我正在尝试更改绘图中的文本标签大小（而不是轴，而是标签注释）
我正在使用phyloseq对象，但我
我的问题与使用phyloseq（）建立一个phyloseq对象有关。我遵循了<a href="https://joey711.github.io/phyloseq/import-data
我正在遵循此管道（<a href="https://www.nicholas-ollberding.com/post/introduction-to-the-statistical-analysis-of-microbiome-data-
我正在尝试创建一个phyloseq对象，但出现错误。我搜索了不同的页面和论坛，但是找不到解决我问题的方
我在R上很难创建我想要的调色板...
我只想在条形图中绘制phyloseq对象（称为physeq）的不同门的分布。
为
我是 <a href="https://benjjneb.github.io/decontam/vignettes/decontam_intro.html" rel="nofollow noreferrer">decontam package in R</a>
我使用自己的数据成功完成了 DADA2 流水线教程 (<a href="https://benjjneb.github.io/dada2/tutorial.html" rel="nofollow nor
我正在研究通过从土壤中提取的 Minion/纳米孔方法生成的测序数据集。我的数据是单次读取的，采用 fasta
我使用库 phyloseq 将 .biom 数据加载到 R 中。
<pre><code>Data2020 <- import_biom("XXX")
mapfile2020 <- impor
我有一棵树，我想得到这棵树的一部分，它是可爱树组的祖先。
<pre><code>library(stats)
library(ape)
tree <
我需要将我的 OTU 表从 phyloseq 对象转换为数据框，以便我可以使用它来运行 PICRUSt2，但 <code>as.data.frame(ph
这是将我的 OTU 表、元数据、分类法和树作为一个对象导入 R 后当前使用的代码。我的问题在最后一行，
我使用 phyloseq 对象（称为“ps_rel_abund”）中的 ggplot2 创建了一个条形图，使用以下代码：
<pre><code>plo
我对 phyloseq 比较陌生，我很难获得一个相对丰度的 otu-table 可以输入到 <a href="https://www.bioconductor.org/packa
这是我如何分离数据集中前 10 个订单以绘制相对丰度的代码。我如何将前 10 个订单 + <strong>第 11 个称为
我想将 y 轴设置为对数刻度，以提高可视化的可读性。
在这样做之前，我的数据看起来正确显示。
我有所有样品的相对丰度 (X)。我还为特定属 (Y) 取了总体的 subset_taxa。我现在如何测量 X 中 Y 的相对丰
<strong>设置</strong>：
R 版本 4.0.5 (2021-03-31)——“摇一摇”
平台：x86_64-pc-linux-gnu（64 位）
Ubuntu 16.04
我目前在 qiime2R 中遇到了一些麻烦。我正在学习教程并卡在这里：
unwunifrac <- read_qza("unweighted_unifrac
