通过使用easyPubMed和大量搜索（我对R还是很陌生），我已经成功地从单个发布的记录中提取了关联数据。

如何从不在PMC中（即没有PMCID）的论文的DOI以编程方式获取PMID？ <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/pm

我已经在生成此代码方面获得了一些帮助： <pre><code>library( xml2 ) library( magrittr ) #read the xml-data doc &lt;

目前，我正在使用Biopython的Esearch来获取搜索词的论文列表。 不幸的是，当我将它们与网络搜索结果（<a

您好，我正在尝试从发布的XML数据集中提取一些信息。这是我的代码的第一部分： <pre><code>from bs4 impo

<a href="https://bern.korea.ac.kr/pubmed/32818866" rel="nofollow noreferrer">https://bern.korea.ac.kr/pubmed/32818866</a> <pre><cod

我正在使用 <code>RISmed</code>r 包以表格格式从 pubmed 中提取摘要。 直到大约 2 个月前，一切都运行良好（

我下载了PubMed XML文件，并想打印出此文件中的所有文章，这是我的代码 <pre><code>import xml.etree.ElementTre

关于从PubMed提取关联信息到R中，我有多个问题和很大的帮助。最初，我是从XML链接中提取的，该XML链接

我正在尝试从PMC / Pubmed下载完整的标题/摘要数据。这是一个古老的问题，但是stackoverflow上的所有答案似

使用Bio Entrez进行搜索时，得到的结果有所不同。例如，当我在浏览器上使用查询“ covid side effect”搜索

RISmed（从技术上讲是EUtilsGet）已决定是有问题的。尝试从约3000个PMID下载标题会导致错误： <pre><code>E

尝试摆脱RISmed带来的麻烦（请参阅<a href="https://stackoverflow.com/questions/64579735/problems-with-rismed-and-largeish-data

我有一个每周脚本，该脚本针对在上周内创建的多个搜索条件，对Pubmed进行抓取。 使用的搜索字词如下

我正在尝试使用他们的 API 通过 R 访问 Pubmed 结果，但与使用 Web 界面时相同的查询获得的结果相比，我

在对 Medline/PubMed 进行 Biopython 搜索时，我一直无法找到有关如何控制术语爆炸的文档。 例如，如果

也许有人知道如何获得标题或摘要与每个解析的搜索查询匹配的出版物的绝对数量，例如： <ul> <li>EGF

我曾经从其 FTP 网站 (ftp.ncbi.nlm.nih.gov) 下载和更新 PubMed 文献元数据。但是最近，我无法像以前那样提取

我正在使用此脚本从 pubmed 获取有关 covid-19 的数据 <pre><code>from Bio import Entrez def search(query): E

我有一个包含来自 <code>pubmed</code> 的文章的数据集。数据框看起来像这样： <pre><code>df = pd.DataFrame({&#3