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seurat
seurat专题提供seurat的最新资讯内容,帮你更好的了解seurat。
无法在服务器上的闪亮应用中渲染图,但可以在本地和Rstudio服务器上工作
我已经被这个问题困扰了好几天了。 我正在构建一个闪亮的应用程序,用户可以在其中选择一个数
作者:佚名 时间:2022-08-15
尝试打开RDS文件时,名称为“ images”的插槽没有错误
我正在尝试打开文件,但似乎遇到了错误。 这是我在RStudio中所做的: <pre><code>file <- readRDS(
作者:佚名 时间:2022-08-14
如何加载 BingleSeq R 包 - Github 存储库
我正在尝试在 R 中执行一些 scRNA-seq,对 R 和类似的编码非常陌生。我最初使用 Seurat,但我在使用 topGO
作者:佚名 时间:2022-08-07
如何更改Seurat Dimplot的默认配色方案?
尊敬的全球专家 你好, 我正在使用Seurat分析整合的单细胞RNA序列数据。 我确认了Dimplot的默认配色
作者:佚名 时间:2022-07-04
无法在R 3.5.2上安装Seurat或devtools
我有R版本3.5.2。直到七月,我都没有安装和运行Seurat和devtools的问题。我了解R版本4现在可用,并且Seurat
作者:佚名 时间:2022-07-06
尝试加载r-seurat时出现UnsatisfiableError
我正在尝试使用r-seurat作为依赖项来创建一个非常简单的conda环境。我的环境Yaml如下所示: <pre><code>ch
作者:佚名 时间:2022-06-13
R带有苏拉特星团DEG的火山图
我正在尝试为以下两个条件生成火山图。 <ol> <li>我想为苏拉特星团绘制火山图;集成数据中的群集1
作者:佚名 时间:2022-06-11
R将Counts.csv.gz文件转换为Seurat对象
我通常通过<code>barcodes.tsv.gz</code>函数将包含<code>features.tsv.gz</code>,<code>matrix.mtx.gz</code>和<code>Read10X</code
作者:佚名 时间:2022-06-06
安装Seurat V.4时遇到问题
我一直在尝试使用他们提供的命令下载Seurat 4.0-<code>remotes::install_github("satijalab/seurat", ref = "releas
作者:佚名 时间:2022-06-06
在Seurat上整合多个控制和治疗条件的工作流程?
对于每种情况,我都有3次生物学重复-对照和治疗。 我正在尝试量化治疗后细胞类型特异性基因表达的
作者:佚名 时间:2022-06-03
R-匹配索引中嵌套列表值和返回值的组合
嗨,我有两个数据集。第一个是与给定簇(0-7)相关的基因列表: <pre><code># gene output Cluster <- rep(0
作者:佚名 时间:2022-06-02
无法正确安装/加载 Rcpp
拼命地尝试加载和使用 Rcpp(其实我正在尝试使用需要 Rcpp 的包 Seurat) <pre><code>> library(Seurat) Error:
作者:佚名 时间:2022-06-02
聚合图中的行
我有一个 seuratObject,rownames 是基因名称,在列表中不是唯一的,colnames 是样本 ID。 <pre><code>counts <-
作者:佚名 时间:2022-05-30
在 Shiny 中从上传的 Seurat 对象中提取元数据以进行选择输入选择
我正在尝试创建一个 Shiny 应用程序,它允许我比较来自 Seurat 对象的簇,并输出差异表达基因的列表。
作者:佚名 时间:2022-05-29
Cholmod 错误“内存不足”:合并 Seurat 对象
我正在尝试合并包含转录组计数数据(稀疏矩阵)的 Seurat 类对象。我对 R 比较陌生,因此感谢任何帮助
作者:佚名 时间:2022-05-26
每个集群的 FeatureScatter 的 facet_grid
我想知道是否可以为 <code>const wsProxy = createProxyMiddleware( 'ws://target.domain', { changeOrigin: tr
作者:佚名 时间:2022-05-26
如何使用列表中的信息在 R 中循环一段代码,并根据同一列表中的信息更改变量名称?
我有这个清单: <pre><code>file_name <- list.files(path = "./GSE124395/", pattern = "\\.csv$",full.names = T
作者:佚名 时间:2022-05-25
R将数据转换为向量
我有一个对象(Seurat 对象),我需要从中获取某些数据 <pre><code>> sc@misc[["colors"]][["seurat_cl
作者:佚名 时间:2022-05-24
Seurat 元数据的特征图
假设我有一个名为 seur 的 Seurat 对象,其元数据包括一个名为“count”(双精度列表)的列,该列显示某
作者:佚名 时间:2022-05-23
你如何将 for 循环的每次迭代的结果恢复到它自己的矩阵中?
我有一个 for 循环,它获取列表中的每个示例文件,为该示例创建一个矩阵,然后将其存储到所有示例矩
作者:佚名 时间:2022-05-22
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