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seurat
seurat专题提供seurat的最新资讯内容,帮你更好的了解seurat。
如何解释 Seurat 对象中 nCount_RNA 的十进制值
我的数据集很奇怪。当我创建 Seurat 对象并为其加载元数据时,nCount_RNA 中的所有值都是十进制值而不是
作者:佚名 时间:2022-05-19
按集群导出 Seurat 对象数据
我正在使用 Seurat 进行单细胞分析,并且有兴趣导出每个集群中所有细胞的数据。我尝试使用以下代码但
作者:佚名 时间:2022-05-17
如何从 Seurat 对象的元数据中提取数据
我一直在尝试制作一个函数来查看每个簇中基因表达的比率。我可以通过将数据集表示到数据框中然后
作者:佚名 时间:2022-05-17
提取簇中至少 10% 的细胞表达的基因名称
我有一个定义了簇的 Seurat 对象。我需要提取由我的集群中至少 10% 的细胞表达的所有基因的列表。我需
作者:佚名 时间:2022-05-16
按簇将 Seurat 数据导出到 CSV 文件并提取特定簇
我正在尝试按单元集群从 Seurat 导出我的数据。到目前为止,以下代码有效,但它将每个集群导出到一个
作者:佚名 时间:2022-05-16
Seurat UMAP 可视化结果在两个相同环境下运行后镜像
当我在本地计算机 RStudio (R 4.0.2) 和 Code Ocean R 4.0.3 上运行相同的 R 代码时,我有两个不同的 UMAP 可视化
作者:佚名 时间:2022-05-11
CreateSeuratObject:输入矩阵中不存在单元格名称列名名称
我使用患者 PBMC 进行了 scRNA-seq,4 次生物学重复。每个 PBMC 都标有 4 种不同类型的标签寡核苷酸,并进
作者:佚名 时间:2022-05-03
将列名添加到我的数据框中Seurat,cellhasing
各位。 我刚刚开始学习如何分析 RNAseq 数据。 我在最开始的步骤中遇到了一个非常基本的问
作者:佚名 时间:2022-05-03
R中Seurat分析中的for循环函数
我试图获得我制作的函数的多个输出 <pre><code>ratio_marker_out_2 = function(marker_gene, cluster_id){ marker_gene = lis
作者:佚名 时间:2022-05-03
无法在 Rstudio 中安装 Seurat
我需要安装 seurat 新版本。我已经按照 Satija Lab 指南和不同的 youtube 视频进行了尝试。我已经安装了 R 和
作者:佚名 时间:2022-04-29
scRNA-seq 数据集中的正标记和负标记
我正在了解 Seurat 在 scRNA-seq 数据集中的标记基因和聚类。但是,我对阳性标记和阴性标记这两个术语感
作者:佚名 时间:2022-04-25
如何将多个相同类型的 pdata 身份添加到一个样本中,并在绘图时能够通过这些身份进行区分
我正在尝试将表型信息 (pdata) 添加到此数据集中的样本中。 <pre><code>library(BiocManager) library(GEOquery) lib
作者:佚名 时间:2022-04-23
如何在使用多变量对象或两个单独对象的组合 ggplot2 图之上添加额外统计信息
我有一个 ggplot2 图,它将两个单独的小提琴图绘制到一个图上,由本示例给出(感谢@jared_mamrot 提供):
作者:佚名 时间:2022-04-23
makeClusterPSOCK ERROR 工作人员无法连接
我在 R 上运行 Seurat 时遇到此错误。 <strong>makeClusterPSOCK(workers, ...) 中的错误: 集群设置失败。
作者:佚名 时间:2022-04-22
PateR 崩溃 R
我正在尝试运行 phateR 教程: <a href="https://cran.r-project.org/web/packages/phateR/readme/README.html" rel="nofollow n
作者:佚名 时间:2022-11-24
有没有办法让 data.frame 中的标识符列成为 R 中自己的列?
我使用了<strong>FindMarkers</strong> 函数(Seurat 函数)来生成数据表。它给出了通常的 5 个变量表,开头是
作者:佚名 时间:2022-11-21
在 Python 中加载 RS4 对象
我有一个包含 Seurat RS4 对象的 rds 文件。我试着跑 <pre><code>result = pyreadr.read_r('P1.seur.rds') </code></
作者:佚名 时间:2022-11-17
是否可以根据条形码从一个样本中合并 2 个 seurat 对象?
我根据一些基因将我的 seurat 对象分成 2 个对象,并分析它们,现在我想根据它们的原始细胞再次合并它
作者:佚名 时间:2022-09-09
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