我正在运行的程序只需要指定目录即可保存输出文件。如果我用 <code>snakemake</code> 运行它，它会给我错
我有以下基本的蛇形设置：
<pre><code>rule step1:
"""
The output will contain a list of GENEs in a txt
我试图通过 docker 容器上的 snakefile 执行 R 脚本。它停止了 PermissionError 指出该行调用 R 脚本。这是消息
我有一个如下所示的输入文件。当我创建通配符时，我收到一个错误，提示找不到文件，因为它们具有
我收到如下错误消息：
规则 base_quality_control_fetal 和 base_quality_control 对于文件 /data/Fetal_BW_European.txt.gz 是
我在集群上使用 Snakemake，但我不知道如何最好地处理某些作业可以被抢占的事实。
对于我使用的
我有一个看起来像这样的蛇形管道：
<pre><code>configfile: "./config.yaml"
IN_DIR = config["in_dir"]
SAM
我正在使用一个相当大的 snakemake 文件来调用 30 位患者的突变。工作流程的第一步是对齐。我遇到的问
我正在尝试使用 Snakemake 规则来拆分和处理大 bam 文件。在 splitBam 规则中，我将 Bam 拆分为我尝试在 Count
我正在从 shell 脚本调用 Snakemake 工作流程。<br/>
但首先我需要激活一个包含snakemake 和其他已安装库的环
我是蛇形的新手，发现它很难做最简单的事情。为了说明，我编写了一个程序 <code>adding_text.py</code>，它
我正在尝试使用 snakemake 自动化集成测试（我需要一些文件的输出，所以这似乎是一个很好的工具）。但
我的 snakemake 工作流程打印混合输入。
<块引用>
/scratch/blumenscheitc/workplace_5z/diaa_nn_fasta/Snakefile 的第
当我在 google 生命科学执行器上运行 snakemake 时，我会运行类似的东西：
<pre><code>snakemake --google-lifesci
例如，如果运行一个向 slurm 求和的作业并通过 <code>scancel -u username</code> 取消 slurm 作业并使用 <code>ctrl-c<
从 <a href="https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/executing/cli.html#profiles" rel="nofollow noreferrer">documentation</a> 中，
我正在尝试为我的增强决策树训练研究最佳超参数。这是两个实例的代码：
<pre><code>user = '/home/.../
我是蛇形的新手。我想在snakemake中使用目录或目录中的所有文件作为输入。例如，两个不同编号的目录
我正在开发一个新的 snakemake 宏基因组学管道来修剪 fastq 文件，并通过 kraken 运行它们。每个样本都有一
我有一个工作流可以在我自己的机器上正确运行，但在提交到集群时失败。该错误似乎是在设置环境变
