我在 SAMPLES 文件夹中有两个输入文件：
<ol>
<li>SRR13510812_1.fastq</li>
<li>SRR13510812_2.fastq</li>
</ol>
但我需
我有一个简单的问题，但我自己就是想不通。
我有一个输入列表 (a,b,c)。对于每个输入，我需要提
我想知道如何设计一个数据库更新 (amrfinder db) 并使用snakemake 进行查询。
规则 update_amrfinder，更新
我有一个 <em>Snakemake</em> 配置文件，可以根据定义的规则将输入数据转换为输出数据。
其中一个输
我正在 Snakemake 中运行宏基因组学管道。我正在为我的程序集运行 MetaSPAdes，但 MetaSPAdes 通常会针对特定
我正在使用 Snakemake 构建管道。一个规则涉及使用 <code>readr</code> 读取 CSV 文件的 R 脚本。当我使用 <code>-
我正在编写一个带有特定文件夹名称的输入文件的 snakemake 文件（在此示例中，<code>barcode9[456]</code>）。
我正在尝试使用 snakemake 整理我的数据分析项目，但我不确定在不同的 snakemake 分析中重用代码的最佳做
我正在尝试创建一个对多个错误源具有鲁棒性的蛇形管道。我想在我的管道中调用一个 bash 脚本。提醒
我有一个 Snakemake 管道，我可以从 json 文件中获取文件夹的输入/输出路径，并使用 expand 函数获取路径。
我正在尝试使用snakemake“snakemake.remote.FTP”从ftp服务器下载文件，如下所示：
<pre><code>from snakemake.remot
我开发的蛇形制作工作流程遇到了一些问题。对于特定规则，snakemake 有时会将输出标识为不完整：
<p
我想知道为具有许多中间文件的脚本编写规则的最佳做法是什么？
R 脚本示例如下：
<pre><code>
da
我的问题与<a href="https://stackoverflow.com/questions/63725022/execute-certain-rule-at-the-very-end#new-answer?newreg=a3460f63381c4
在运行我的 Snakemake 管道时，我收到以下错误：
<pre><code>MissingInputException in line 19 of Snakefile:
Missing inpu
我检索了一个 Docker 文件，当我在全局环境中启动它时，它运行良好。
当我在 Snakefile 中启动它时，它也
在我的 Snakemake 工作流程中，我定义了一个函数，该函数使用之前在工作流程中生成的文件，对其进行解
我正在尝试了解具有多个配置和配置文件层的复杂 Snakemake 工作流程。
在Snakefile中，引用了一个未
我在尝试运行调用 R 脚本的蛇形规则时遇到问题。相关的蛇形规则如下所示：
<pre><code>p.wait()</code></pr
如何以编程方式引用另一个 Snakemake 规则的属性？我需要用什么替换 <code><whatever is in test1's input><
