我目前正在写一条流水线，生成阳性RNA序列，对其进行混排，然后分析阳性序列和混排的（负）序列。
有人在识别超时工作时遇到问题吗？我使用<code>qsub</code>将作业提交到群集，并按规则设置了超时：
<
我有输入文件：
<pre><code>Bob_1.fastq.gz
Bob_2.fastq.gz
Bob_3.fastq.gz
Bob_4.fastq.gz
Ron_1.fastq.gz
Ron_2.fastq.gz
Ron_3.fast
我有一个蛇形工作流，其中包含一个运行另一个“内部”蛇形工作流的规则。<br/>
有时内部工作流的某
为了分解它，我有一个看起来像这样的字典：
<pre><code>dict = {'A': ["sample1","sample2",
我刚刚在共享系统上安装了 Snakemake（使用 sudo），当我运行它时，即使是 <code>snakemake --version</code>，我
我遇到了以下问题：
我的 Snakemake 程序无法识别我的 python 脚本生成的输出。我尝试了这两种方法，将输
我正在尝试在 docker 容器中运行一条蛇形命令。我使用命令 <code>snakemake -j all --use-singularity --verbose</code>
我想在 Google Cloud 平台上使用 Snakemake，所以我使用了本教程：<a href="https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/exec
我有一个带有规则的 Snakefile，可以使用 samtools 1.9 版从 yaml 文件创建和激活 conda 环境，然后检查版本：<
我有一个带有调用其他程序和自定义 R 和 python 脚本的规则的蛇形管道。
我有多个数据集，需要在
我有一个工作流，它需要一个 slurm 集群具有不同资源需求（内存和时间）的令人尴尬的并行步骤。我按
对于snakemakev5.27+
有没有办法用指向本地图像的容器指令运行snakemake？例如。如果我将 Docker 容器存
对于snakemake v5.27+
无论如何要配置 linter，以便它接受某些警告？
对于一个项目，我使用 Python3 创建了一个虚拟环境 (venv)。在激活我的 venv 后，我使用一个简单的 bash 脚
为了加快我的工作流程，我想做一些类似于 <a href="https://stackoverflow.com/questions/49574969/snakemake-unknown-output-
我正在尝试创建一个采用 TSV 表配置的 Snakemake 工作流程，如下所示：
<pre><code>sample path
s1 /path/to/
我正在尝试运行我的蛇形管道。这就是我到目前为止所拥有的，简而言之，我搜索了一些路径以找到所
我正在尝试构建一个 snakemake 工作流程，如果本地文件存在，它将提供指向本地文件的符号链接，或者如
我有一个 Snakemake 工作流程，其中包含一个 Snakefile 和一个配置文件。在我的 Snakefile 中，我指定了一个
