我正在尝试将我的蛇形管道包装到一个奇点容器中。
但是当我想运行我的容器时，我什至无法召唤snakema
假设我有一个规则，90% 的数据需要 1 小时，但偶尔需要 3 小时。然而，在繁忙的集群环境中，我不想提
运行以下规则时得到 <code>MissingInputException</code>：
<pre><code>configfile: "Configs.yaml"
rule download_data_f
我正在尝试使用 snakemake 构建管道。我创建了一个使用 python v3.9 的 conda 环境，还包含了 snakemake 程序。
如标题所示，我的 Snakefile 在 all 规则中给了我一个扩展函数的语法错误。我知道这通常是由空格/缩进错
我遵循 <a href="https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/executing/caching.html" rel="nofollow noreferrer">official document</a> 进
我有一个相当复杂的工作流程，包含 750 个样本和大约 18.000 个作业，起初snakenmake 运行得很好，但在大
我正在尝试重命名文件夹名称和其中的文件，就像在这个问题 (<a href="https://stackoverflow.com/questions/66115492/
我们为平台的每个版本运行了许多脚本，我们希望使用 Snakemake 自动运行这些脚本。计划是在 Google Cloud
我正在尝试使用 Azure Blob 存储在 Kubernetes 上运行 GiRaF (<a href="https://github.com/sdwfrost/giraf" rel="nofollow noreferr
我正在研究这个蛇形管道，其中最后一条规则如下所示：
<pre><code>rule RunCodeml:
input:
'{P
我是生物学家，所以如果这是一个非常基本的问题并且我无法使用正确的术语，我真的很抱歉。
我
我正在编写一条蛇形规则，该规则将从已解析的 yaml 中获取输入值并将与该组标签关联的文件作为列表
我正在尝试使用以下规则从 snakemake 中使用 python 脚本
<pre><code>rule split_cells:
input:
base_path + "{samp
我有一个我认为应该很容易解决的问题，但由于某种原因我无法解决它..
我在 Snakemake 内部使用 GNU paralle
我有一个运行 python 脚本的 Snakefile，它在一个目录中输出许多文件。我写了下面的 Snakefile 脚本来执行这
我想模仿递归复制目录结构（如在 <code>cp -r</code> 或 <code>rsync -a</code> 中），但只接触复制的文件，即使
当我运行以下 snakemake 代码时，我得到一个 <code>MissingInputException</code>：
<pre class="lang-py prettyprint-overri
[最初在 <a href="https://bioinformatics.stackexchange.com/questions/15431/snakemake-fails-because-it-cannot-create-logs-inside-a-read-
我正在尝试为生物信息学工具 FMAP 创建规则文件。 <a href="https://github.com/jiwoongbio/FMAP" rel="nofollow noreferrer"
