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我有来自特定种族的VCF文件列表,例如美洲印第安人,中国人,欧洲人等 在每个种族下,我都有大
我正在尝试利用 vcftools 包来计算堰和科克汉姆的 fst。我想在第一个实例中遍历两对种群,然后在 1000 Gen
我的输入数据是一个 VCF(变体调用格式)文件。我感兴趣的每一行看起来像这样: <pre><code>chrI 2223
我开发了一个用 Snakemake 编写的管道,用于基因组变异调用分析。 我正在尝试 <a href="https://github.com/ray2g/
我正在使用 htslib 提取包含在 C++ 中的 VCF 文件中的所有信息。 目前,多亏了<a href="https://samtools.gith
我正在尝试使用包“popgenome”和“readData”将 multiVCF 文件(使用 GATK 创建,约 80 个人(4.3Gb))导入 R。
我有大约 200 个文件,它们的标题行很长,以“#”开头,然后记录 4 列,如下所示: <pre><code>file_1.vcf
我想使用 bash 删除以下 txt 文件中的字符串“chr”: <pre><code> FO538757.1 chr1:183937 AL669831.3 c
下午好, 在浏览堆栈溢出并没有找到我的特定问题的解决方案后,我决定询问社区,希望这对其他
要更新我的摘要统计文件的 SNP ID,我有一些问题:首先,我从摘要统计文件创建了一个文本文件,其中
是否可以使用 <a href="https://github.com/jamescasbon/PyVCF" rel="nofollow noreferrer">pyvcf</a> python 包检查 VCF 中的 ALT 字
请假装我有以下情况(多列和多行): <pre><code>TUNE_PKGARCH</code></pre> 想要的是 awk 循环遍历每一列并