使用带有 64 位整数作为 StorageIndex 的 SparseMatrix 的 Eigen Pardiso

如何解决使用带有 64 位整数作为 StorageIndex 的 SparseMatrix 的 Eigen Pardiso

我最近在使用 Eigen Pardiso 开发代码时遇到了一些问题。

以前,我使用 Eigen Pardiso 来求解二维泊松方程。矩阵大小可以用 C/C++ 32 位整数来描述。我使用的代码是这样的:

#define EIGEN_USE_MKL_ALL
typedef Eigen::SparseMatrix<double,Eigen::ColMajor> SpMat;
typedef Eigen::Triplet<double> Trp;

......
int nx;
int ny;
SpMat A(nx*ny,nx*ny);
Eigen::VectorXd b=Eigen::VectorXd::Zeros(nx*ny);
Eigen::VectorXd sol=Eigen::VectorXd::Zeros(nx*ny);
Eigen::PardisoLU<SpMat> *ptrLUsolver;
ptrLUsolver = new Eigen::PardisoLU<SpMat>();
// Set-up coefficients for A and set RHS vector b
......
//
(*ptrLUsolver).compute(A);
sol = (*ptrLUsolver).solve(b);
if (ptrLUsolver != NULL)
{
        delete ptrLUsolver;
}
......

这对我很有效。

但是,我最近需要修改我的代码以处理更大的 3D 矩阵。上面代码中的nx*ny需要改成nx*ny*nz,这个值比C/C++中的32位int要大。所以这些变量需要在 C/C++ 中更改为 64 位 int64_t。上面代码修改后的代码如下:

#define EIGEN_USE_MKL_ALL
typedef Eigen::SparseMatrix<double,Eigen::ColMajor,int64_t> SpMat;
typedef Eigen::Triplet<double,int64_t> Trp;

......
int64_t nx;
int64_t ny;
int64_t nz;
SpMat A(nx*ny*nz,nx*ny*nz);
Eigen::VectorXd b=Eigen::VectorXd::Zeros(nx*ny*nz);
Eigen::VectorXd sol=Eigen::VectorXd::Zeros(nx*ny*nz);
Eigen::PardisoLU<SpMat> *ptrLUsolver;
ptrLUsolver = new Eigen::PardisoLU<SpMat>();
// Set-up coefficients for A and set RHS vector b
......
//
(*ptrLUsolver).compute(A);
sol = (*ptrLUsolver).solve(b);
if (ptrLUsolver != NULL)
{
    delete ptrLUsolver;
}

现在问题来了。好像把StorageIndex类的默认SparseMatrix改成int64_t,代码根本编译不出来。 错误信息是这样的:

error: cannot convert ‘long int*’ to ‘const int*’
       ::pardiso(pt,&maxfct,&mnum,&type,&phase,&n,a,ia,ja,perm,&nrhs,iparm,&msglvl,b,x,&error);
       ~~~~~~~~~^~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

然后我来看看 Eigen 的源代码。似乎有类似的东西:

namespace internal
{
  template<typename IndexType>
  struct pardiso_run_selector
  {
    static IndexType run( _MKL_DSS_HANDLE_t pt,IndexType maxfct,IndexType mnum,IndexType type,IndexType phase,IndexType n,void *a,IndexType *ia,IndexType *ja,IndexType *perm,IndexType nrhs,IndexType *iparm,IndexType msglvl,void *b,void *x)
    {
      IndexType error = 0;
      ::pardiso(pt,&error);
      return error;
    }
  };
  template<>
  struct pardiso_run_selector<long long int>
  {
    typedef long long int IndexType;
    static IndexType run( _MKL_DSS_HANDLE_t pt,void *x)
    {
      IndexType error = 0;
      ::pardiso_64(pt,&error);
      return error;
    }
  };

从错误信息来看,我认为代码调用了pardiso函数。所以我认为代码可能需要找到某种方法来使用 pardiso_64 函数。我试图在上面显示的代码的上述修改版本上将 int64_t 更改为 long long int。然后编译器显示错误:

eigen-3.3.9/Eigen/src/Core/util/XprHelper.h:833:24: error: static assertion failed: YOU_MIXED_DIFFERENT_NUMERIC_TYPES__YOU_NEED_TO_USE_THE_CAST_METHOD_OF_MATRIXBASE_TO_CAST_NUMERIC_TYPES_EXPLICITLY
   EIGEN_STATIC_ASSERT((Eigen::internal::has_ReturnType<ScalarBinaryOpTraits<LHS,RHS,BINOP> >::value),\
eigen-3.3.9/Eigen/src/Core/util/StaticAssert.h:33:54: note: in definition of macro ‘EIGEN_STATIC_ASSERT’
     #define EIGEN_STATIC_ASSERT(X,MSG) static_assert(X,#MSG);
eigen-3.3.9/Eigen/src/Core/AssignEvaluator.h:834:3: note: in expansion of macro ‘EIGEN_CHECK_BINARY_COMPATIBILIY’
   EIGEN_CHECK_BINARY_COMPATIBILIY(Func,typename ActualDstTypeCleaned::Scalar,typename Src::Scalar);
   ^~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
eigen-3.3.9/Eigen/src/SparseCore/SparseSelfAdjointView.h:641:59: error: cannot bind non-const lvalue reference of type ‘Eigen::SparseMatrix<double,long long int>&’ to an rvalue of type ‘Eigen::SparseMatrix<double,long long int>’
     internal::permute_symm_to_fullsymm<Mode>(src.matrix(),tmp,src.perm().indices().data());

请问如何在 Eigen 中使用 Pardiso 和 int64_t?提前致谢。

我使用的特征是 Eigen 3.3.9。 我使用的编译器是 GCC 8.4.0

解决方法

我认为在 64 位系统上,Eigen 使用 long int 作为索引和大小的默认类型。但是 pardiso_64 需要每个参数都和 long long int 一样长。

https://software.intel.com/content/www/us/en/develop/documentation/onemkl-developer-reference-c/top/sparse-solver-routines/onemkl-pardiso-parallel-direct-sparse-solver-interface/pardiso-64.html

在 Eigen 文档中,EIGEN_DEFAULT_DENSE_INDEX_TYPE 默认设置为 std::ptrdiff_t。这个 std::ptrdiff_t 用于指针运算和数组索引。使用其他类型(例如 int)的程序可能会失败,例如当索引超过 INT_MAX 或者它依赖于 32 位模运算时,64 位系统。

因此尝试将 EIGEN_DEFAULT_DENSE_INDEX_TYPE 更改为 long long int。

https://eigen.tuxfamily.org/dox/TopicPreprocessorDirectives.html

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