使用 Anaconda 在 Mac OS X 11.2.2 上安装 PyGMO 期间的冲突

如何解决使用 Anaconda 在 Mac OS X 11.2.2 上安装 PyGMO 期间的冲突

我正在尝试在 Mac OS X 11.2.2 上安装 PyGMO（使用我重新安装的 Anaconda，因此 Anaconda Navigator 现在升级到 2.0.1。）

安装开始后，它会收集包元数据并报告发现包冲突。如何解决冲突以便我可以运行 PyGMO？

开始：

$ conda install -c conda-forge pygmo
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.
Solving environment: failed with repodata from current_repodata.json,will retry with next repodata source.
Collecting package metadata (repodata.json): done
Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.
Solving environment: \ 
Found conflicts! Looking for incompatible packages.

几个小时后，终端返回一份长长的冲突报告并停在那里。这是一个有代表性的输出：

Package selectors2 conflicts for:
wurlitzer -> selectors2
spyder-kernels -> wurlitzer[version='>=1.0.3'] -> selectors2

Package mpmath conflicts for:
anaconda==2020.07=py38_0 -> sympy==1.6.1=py38_0 -> mpmath[version='>=0.19']
sympy -> mpmath[version='>=0.19']
anaconda==2020.07=py38_0 -> mpmath==1.1.0=py38_0

Package anyio conflicts for:
jupyterlab -> jupyter_server[version='>=1.4,<2'] -> anyio[version='>=2.0.2|>=2.0.2,<3']
jupyterlab_server -> jupyter_server[version='>=1.4,<3']

Package py-lief conflicts for:
conda-build -> py-lief
anaconda==2020.07=py38_0 -> py-lief==0.10.1=py38haf313ee_0
Note that strict channel priority may have removed packages required for satisfiability.

我关注了 the official installation guidelines 并设置了附加频道及其优先级。我也检查了 this command 但这本质上是一样的。我还尝试了 PyPI 中的安装命令。我也试过这个hint

解决方法

有两种可能的状态：

1. Conda 求解器是正确的。您在环境中的先前包限制与安装 pygmo 不兼容。在这种情况下，您要么需要追踪冲突的约束并尝试手动放松它们（不推荐用于 Anaconda base），或者您需要创建一个新环境：

    conda create -n pygmo_env -c conda-forge pygmo
   

   在其中包含您需要的任何其他软件包。例如，ipykernel 如果您打算将其用作 Jupyter 内核。

2. Conda 求解器出问题了。求解器报告了不应该解决的问题。这种情况会发生，尤其是在混合通道（defaults 和 conda-forge）时发生。许多人发现 Mamba（Conda 的直接替代品）更可靠（而且绝对更快！）。

   conda install conda-forge::mamba
   mamba install -c conda-forge pygmo
   

不幸的是，很难说它处于哪个状态。我们中的许多人一直在试图对约束报告进行分类的过程中陷入困境，有时确实找不到合理的冲突。出于实用目的，我建议您尝试使用 mamba。如果它也失败了，那么至少您将有充分的证据证明您处于 (1) 状态。

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附加评论

尽管有关于从 Anaconda Cloud 中的任何渠道安装的乐观文档，但 Anaconda 发行版受到高度限制 - 即包含太多包 - 并且仅测试来自 defaults 渠道的包的共同安装。此外，Conda Forge 和 Anaconda 具有不同的构建堆栈，因此即使求解器允许共同安装，也可能存在运行时包不兼容的情况。

通常，我建议自由使用环境创建。旨在为单独的任务/项目提供单独的环境。如果您计划经常使用的不仅仅是普通的 Anaconda 发行版，请考虑 Miniforge 或其变体之一。始终可以使用 conda create -n foo -c defaults anaconda 创建 Anaconda 环境。