使用 OpenMPI 和 OpenMP 的混合并行编程:OpenMP 线程始终使用每个节点 4 个内核中的 1 个

如何解决使用 OpenMPI 和 OpenMP 的混合并行编程:OpenMP 线程始终使用每个节点 4 个内核中的 1 个

我使用 3 个 Raspberry PI 板创建了一个家庭集群来学习和试验混合并行编程。 我的设置如下:- 1 个 RPi3 B+(4 核)和 2 个 RPi4(每个 4 核),所有这些节点都使用交换机通过以太网连接。因此,我的集群中总共有 12 个内核。 RPI3B+被指定为node1,其余两个RPI4板分别为node2和node 3。

我使用 OpenMPI 和 OpenMP 编写了一个简单的程序,它总结了两个大向量。

代码结构如下:- 我的意图是 - 我将启动 3 个等级为 0、1 和 2 的 MPI 进程,并将它们分别绑定到节点 1、节点 2 和节点 3。从每个 MPI 进程内部,我将启动 4 个 OMP 线程,这些线程将完成对分布式向量块进行汇总并将结果返回到 0 级的工作。

虽然代码正在运行并给出了正确的结果,但我的观察是 OMP 线程没有利用节点中存在的所有 CPU 内核。使用 htop,我注意到每个节点上只有 1 个核心是 100% 加载的。

我启动程序的方式如下:- #mpirun --map-by node --display-devel-map --hostfile nodeconfig -np 3 ./addVectorsMPIHybrid 3000000 3000000

nodeconfig 只包含节点的名称,即 node1、node2 和 node3

请注意:我已验证在#pragma 并行部分中创建了 4 个 omp 线程。

谁能给我指点 - 为什么 OMP 线程没有在所有内核上运行?

我正在运行的代码:

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <mpi.h>
#include <assert.h>
#include <omp.h>

int main(int argc,char *argv[])
{
    double *v1,*v2,*resulv;
    double *v1local,*v2local,*resulvlocal;

    double startTime,endTime;

    int rank,size;
    int local_n;
    int n;
    int root = 0;
    int provided;

    if(argc <2)
    {
        printf("Please provide correct inputs\n");
        exit(0);
    }

    n = atoi(argv[1]);
    if(n <=0)
    {
        printf("Please enter valid size of vector\n");
        exit(0);
    }

    //MPI_Init(NULL,NULL);
    MPI_Init_thread(NULL,NULL,MPI_THREAD_FUNNELED,&provided);
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&rank);
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&size);

    local_n = n/size;

    if(rank == 0)
    {
        v1 = (double *) malloc (sizeof(double) *  n);
        assert(v1);
        
        v2 = (double *) malloc (sizeof(double) *  n);
        assert(v2);
        
        resulv = (double *) malloc (sizeof(double) *  n);   
        assert(resulv);

        resulv[n] = {0};
        
        for(int i=0; i<n; i++)
            v1[i] = v2[i] = (double)i;
    }

    v1local = (double *) malloc (sizeof(double) *  local_n);
    assert(v1local);
    
    v2local = (double *) malloc (sizeof(double) *  local_n);
    assert(v2local);

    resulvlocal = (double *) malloc (sizeof(double) *  local_n);   
    assert(resulv);

    resulvlocal[local_n] = {0.0};

    startTime = MPI_Wtime();

    //Scatter v1
    MPI_Scatter(v1,local_n,MPI_DOUBLE,v1local,root,MPI_COMM_WORLD);
    MPI_Scatter(v2,v2local,MPI_COMM_WORLD);


    #pragma omp parallel num_threads(4) default(none) shared(resulvlocal,v2local) firstprivate(local_n)
    {
        #pragma omp single
        {
            printf("num_threads = %d\n",omp_get_num_threads());
        }
        #pragma omp for
        for(int i=0; i<local_n; i++)
            resulvlocal[i] = v1local[i] + v2local[i];
    }
    MPI_Gather(resulvlocal,resulv,MPI_COMM_WORLD);

    endTime = MPI_Wtime();



    if(rank == 0)
    {
        //Display resulv
        #if 0
        for(int i=0; i<n; i++)
            printf("%0.3f ",resulv[i]);
        printf("\n");
        #endif
        
        printf("Time taken to compute is:%f in sec\n",endTime-startTime);

        free(v1);
        free(v2);
        free(resulv);
    }

    free(v1local);
    free(v2local);
    free(resulvlocal);

    MPI_Finalize();

    return 0;
}

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