Dask Cluster 不处理任何数据,一段时间后只是闲置,几周前它工作得很好

如何解决Dask Cluster 不处理任何数据,一段时间后只是闲置,几周前它工作得很好

所以我正在尝试使用 dask 集群并行化该过程。这是我的尝试。

准备集群:

gateway = Gateway(
    address="http://traefik-pangeo-dask-gateway/services/dask-gateway",public_address="https://pangeo.aer-gitlab.com/services/dask-gateway",auth="jupyterhub",)
options = gateway.cluster_options()
options
cluster = gateway.new_cluster(
    cluster_options=options,)
cluster.adapt(minimum=90,maximum=100)
client = cluster.get_client()
cluster
client

然后我有一个函数可以从 S3 加载文件并对其进行处理,然后将其上传回不同的 s3 存储桶。

函数处理GOES数据并从中选择特定区域并将其保存到nc文件然后到S3

def get_records(rec):
    
    d=[rec[-1][0:4],rec[-1][4:6],rec[-1][6:8],rec[-1][9:11],rec[-1][11:13]] 
    
    yr=d[0]
    mo=d[1]
    da=d[2]
    hr=d[3]
    mn=d[4]
    
    ps = s3fs.S3FileSystem(anon=True)

    period = pd.Period(str(yr)+str('-')+str(mo)+str('-')+str(da),freq='D')
    dy=period.dayofyear
    print(dy)

    cc=[7,8,9,10,11,12,13,14,15,16]  #look at the IR channels only for now
    dy="{0:0=3d}".format(dy)

    # this loop is for 10 different channels
    for c in range(10):
        ch="{0:0=2d}".format(cc[c])

    # opening 2 different time slices of given particular record
        F1=xr.open_dataset(ps.open(ps.glob('s3://noaa-goes16/ABI-L1b-RadF/'+str(yr)+'/'+str(dy)+'/'+str("{0:0=2d}".format(hr))+'/'+'OR_ABI-L1b-RadF-M3C'+ch+'*')[-2]))[['Rad']]

        F2=xr.open_dataset(ps.open(ps.glob('s3://noaa-goes16/ABI-L1b-RadF/'+str(yr)+'/'+str(dy)+'/'+str("{0:0=2d}".format(hr))+'/'+'OR_ABI-L1b-RadF-M3C'+ch+'*')[-1]))[['Rad']]
      
    # Selecting data as per given record radiance
        G1 = F1.where((F1.x >= (rec[0]-0.005)) & (F1.x <= (rec[0]+0.005)) & (F1.y >= (rec[1]-0.005)) & (F1.y <= (rec[1]+0.005)),drop=True)
        G2 = F2.where((F2.x >= (rec[0]-0.005)) & (F2.x <= (rec[0]+0.005)) & (F2.y >= (rec[1]-0.005)) & (F2.y <= (rec[1]+0.005)),drop=True)
       
    # Concating 2 time slices togethere
        G = xr.concat([G1,G2],dim  = 'time')

    # Concatiating different channels
        if c == 0:
            T = G    
        else:
            T = xr.concat([T,G],dim = 'channel')

    # Saving into nc file and storing them to S3
    path = rec[-1]+'.nc'
    T.to_netcdf(path)
    fs.put(path,bucket+path)    

使用 dask 并行运行它们。我让所有集群运行 50 个文件一次,然后清除内存并再次运行它以运行下一个 50 个文件

for j in range(0,len(records),50):
   files = []
   for i in range(j,j+50):
        s3_ds = dask.delayed(get_records)(records[i])
        files.append(s3_ds)

    files = dask.compute(*files)
    client.restart()

所以现在的问题是我的集群将处理文件一段时间,就像我有 10 个集群在运行一样,所以过一段时间后,它们会一个接一个地停止处理数据并处于理想状态,即使它们还有内存在他们之中。他们不会做任何事情。他们将处理 20-30 个文件,然后什么都不做。所以我尝试一次只提供 20 个文件,然后他们会在 10-12 个文件后停止处理。下面我附上了一些图像,即使它们有内存,它们也是如何理想地放置的。最重要的是,在我运行相同代码之前的几周,它运行得非常好。我现在不知道是什么问题。

enter image description here

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。

相关推荐


使用本地python环境可以成功执行 import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt # 设置字体 plt.rcParams[&#39;font.sans-serif&#39;] = [&#39;SimHei&#39;] # 能正确显示负号 p
错误1:Request method ‘DELETE‘ not supported 错误还原:controller层有一个接口,访问该接口时报错:Request method ‘DELETE‘ not supported 错误原因:没有接收到前端传入的参数,修改为如下 参考 错误2:cannot r
错误1:启动docker镜像时报错:Error response from daemon: driver failed programming external connectivity on endpoint quirky_allen 解决方法:重启docker -&gt; systemctl r
错误1:private field ‘xxx‘ is never assigned 按Altʾnter快捷键,选择第2项 参考:https://blog.csdn.net/shi_hong_fei_hei/article/details/88814070 错误2:启动时报错,不能找到主启动类 #
报错如下,通过源不能下载,最后警告pip需升级版本 Requirement already satisfied: pip in c:\users\ychen\appdata\local\programs\python\python310\lib\site-packages (22.0.4) Coll
错误1:maven打包报错 错误还原:使用maven打包项目时报错如下 [ERROR] Failed to execute goal org.apache.maven.plugins:maven-resources-plugin:3.2.0:resources (default-resources)
错误1:服务调用时报错 服务消费者模块assess通过openFeign调用服务提供者模块hires 如下为服务提供者模块hires的控制层接口 @RestController @RequestMapping(&quot;/hires&quot;) public class FeignControl
错误1:运行项目后报如下错误 解决方案 报错2:Failed to execute goal org.apache.maven.plugins:maven-compiler-plugin:3.8.1:compile (default-compile) on project sb 解决方案:在pom.
参考 错误原因 过滤器或拦截器在生效时,redisTemplate还没有注入 解决方案:在注入容器时就生效 @Component //项目运行时就注入Spring容器 public class RedisBean { @Resource private RedisTemplate&lt;String
使用vite构建项目报错 C:\Users\ychen\work&gt;npm init @vitejs/app @vitejs/create-app is deprecated, use npm init vite instead C:\Users\ychen\AppData\Local\npm-
参考1 参考2 解决方案 # 点击安装源 协议选择 http:// 路径填写 mirrors.aliyun.com/centos/8.3.2011/BaseOS/x86_64/os URL类型 软件库URL 其他路径 # 版本 7 mirrors.aliyun.com/centos/7/os/x86
报错1 [root@slave1 data_mocker]# kafka-console-consumer.sh --bootstrap-server slave1:9092 --topic topic_db [2023-12-19 18:31:12,770] WARN [Consumer clie
错误1 # 重写数据 hive (edu)&gt; insert overwrite table dwd_trade_cart_add_inc &gt; select data.id, &gt; data.user_id, &gt; data.course_id, &gt; date_format(
错误1 hive (edu)&gt; insert into huanhuan values(1,&#39;haoge&#39;); Query ID = root_20240110071417_fe1517ad-3607-41f4-bdcf-d00b98ac443e Total jobs = 1
报错1:执行到如下就不执行了,没有显示Successfully registered new MBean. [root@slave1 bin]# /usr/local/software/flume-1.9.0/bin/flume-ng agent -n a1 -c /usr/local/softwa
虚拟及没有启动任何服务器查看jps会显示jps,如果没有显示任何东西 [root@slave2 ~]# jps 9647 Jps 解决方案 # 进入/tmp查看 [root@slave1 dfs]# cd /tmp [root@slave1 tmp]# ll 总用量 48 drwxr-xr-x. 2
报错1 hive&gt; show databases; OK Failed with exception java.io.IOException:java.lang.RuntimeException: Error in configuring object Time taken: 0.474 se
报错1 [root@localhost ~]# vim -bash: vim: 未找到命令 安装vim yum -y install vim* # 查看是否安装成功 [root@hadoop01 hadoop]# rpm -qa |grep vim vim-X11-7.4.629-8.el7_9.x
修改hadoop配置 vi /usr/local/software/hadoop-2.9.2/etc/hadoop/yarn-site.xml # 添加如下 &lt;configuration&gt; &lt;property&gt; &lt;name&gt;yarn.nodemanager.res