基因组范围 - 在单个文件中合并重叠 (R STUDIO)

如何解决基因组范围 - 在单个文件中合并重叠 (R STUDIO)

我想在文件中找到重叠的区域并合并它们,保持较早的开始和较晚的停止(将 2 个区域合并为 1)

我打算使用基因组范围,但我不确定如何编写脚本。

这是文件 fileA.txt 包含的内容:

// Display the field
add_action( 'woocommerce_review_order_before_payment','switch_toggle_fee_on_checkout',20 );
function switch_toggle_fee_on_checkout() {

    echo '<div class="switch-toggle-wrapper">
    <span>' . __("To add the company discount,toggle this switch.","woocommerce") . ' </span>
    <label class="switch">
        <input type="checkbox" name="company_discount" id="company_discount">
        <span class="slider round"></span>
    </label>
    </div>';
}

// jQuery Ajax sender function
add_action( 'wp_footer','checkout_toggle_discount_script' );
function checkout_toggle_discount_script() {
    if( is_checkout() && ! is_wc_endpoint_url() ) :

    if( WC()->session->__isset('enable_discount') ) {
        WC()->session->__unset('enable_discount');
    }
    ?>
    <script type="text/javascript">
    jQuery( function($){
        if (typeof wc_checkout_params === 'undefined')
            return false;

        $('form.checkout').on('change','input[name="company_discount"]',function(){
            console.log('toggle');
            var toggle = $(this).prop('checked') === true ? '1' : '0';
            $.ajax( {
                type: 'POST',url: wc_checkout_params.ajax_url,data: {
                    'action': 'enable_discount','discount_toggle': toggle,},success: function (result) {
                    $('body').trigger('update_checkout');
                },});
        });
    });
    </script>
    <?php
    endif;
}

// Ajax receiver: Set a WC_Session variable
add_action( 'wp_ajax_enable_discount','checkout_enable_discount_ajax' );
add_action( 'wp_ajax_nopriv_enable_discount','checkout_enable_discount_ajax' );
function checkout_enable_discount_ajax() {
    if ( isset($_POST['discount_toggle']) ) {
        WC()->session->set('enable_discount',esc_attr($_POST['discount_toggle']) ? true : false );
        echo esc_attr($_POST['discount_toggle']);
    }
    wp_die();
}

// Set the discount
add_action( 'woocommerce_cart_calculate_fees','checkout_set_discount',20,1 );
function checkout_set_discount( $cart ) {
    if ( ( is_admin() && ! defined('DOING_AJAX') ) || ! is_checkout() )
        return;

    $subtotal   = WC()->cart->get_subtotal();
    $percentage = 5;
    $discount   = $subtotal * $percentage / 100; 

    // Give 5% discount if and when the switch is toggled
    if( WC()->session->get('enable_discount') ) {
        $cart->add_fee( sprintf( __( 'Company Discount (%s)','woocommerce'),$percentage .'%' ),-$discount );
    }
}

脚本:

chr     start       end       value
chr1    58708485    58708713  1
chr1    58709084    58710538  2
chr1    98766295    98766639  3
chr1    98766902    98770338  4

我不确定如何为单个文件设置查询和主题,以及作为文档的对象需要任何类型的“”或特定格式(bedGraph、txt 可以吗?)才能被识别在脚本中?

非常感谢您的帮助!

K.

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