如何解决使用 geom_signif 比较 x 轴的值
使用 ggpubr::geom_signif
可以轻松地为 X 轴上的不同值或组添加比较。
这是一个例子
ex = data.frame(time = c("A","B","C","D","E"),effect = runif(n = 1000,min = 0,max = 100),group = c("blue","red"))
comparisons = list(
c(1,2),c(1,3),4),5)
)
ex %>%
ggplot(aes(x = time,y = effect,group = group)) +
stat_summary(geom = "point") +
stat_summary(geom = "line") +
geom_signif(comparisons = comparisons,step_increase = 0.1)
如何在每个时间点内进行比较? 我想要的输出以相同的方式呈现数据,但每个时间点的组之间的差异都有 P 值。
解决方法
对于所有这些 p 值的计算是否合理或正确,至少值得怀疑。无论如何 - 显示您想要的一种方法是按时间将组作为 x 和方面
对于您的分析类型,您似乎将每个时间点视为独立的(它们不是,它们是相关的),并且视觉等效是将它们分离到各个方面,而不是将它们与一条线联系起来。
comparisons = list(
c(1,2))
ex %>%
ggplot(aes(x = group,y = effect)) +
stat_summary(geom = "point") +
stat_summary(geom = "line") +
facet_wrap(~time) +
geom_signif(comparisons = comparisons,step_increase = 0.1)
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