如何解决3D 散点图使用符号作为 R 中的标记符号
我无法使用 plotly
包在 R 中以 3D 散点图显示我想要的所有符号。我知道我正在扩展可区分的内容(例如调色板大于 n=8 并且符号大于 n=6,R 发出警告),这对于我的探索目的来说是可以的,但是有没有办法强制编码我想要的标记样式?。我试图遵循这个 question 的答案,但它在我的情况下不起作用,所以我尝试提取可用的实际符号并对其进行硬编码。我真正想要的是颜色和形状都因分类变量“物种”而异。
这是我的假数据,我试图模仿 PCA 的结果:
df <- data.frame(my_x=rnorm(n=58,sd=30),my_y=rnorm(n=58,sd=20),my_z=rnorm(n=58,sd=35),species=rep(letters,times=3,length.out=58))
#extracting possible symbols from plotly
vals <- schema(F)$traces$scatter$attributes$marker$symbol$values
vals <- grep("-",vals,value = T)
vals1 <- rep(vals[sample(x=c(1:length(vals)),size=58,replace = FALSE)
plot_ly() %>%
add_trace(x= ~df$my_x,y= ~df$my_y,z= ~df$my_z,type="scatter3d",mode="markers",color=~df$species,symbol= ~I(vals1),marker = list(opacity = 0.7))
在 Windows 10 上的 RStudio 版本 1.4.1103 中使用 R 版本 4.0.3 绘制 4.9.3 版。
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