如何编写函数将数据拟合到 N 个类高斯峰值的总和,而无需明确定义每个可能的 N 的表达式?

如何解决如何编写函数将数据拟合到 N 个类高斯峰值的总和,而无需明确定义每个可能的 N 的表达式?

我正在尝试将高斯峰的进展拟合为光谱线形。 级数是 N 个均匀分布的高斯峰的总和。当编码为函数时,N=1 的公式如下所示:

A * ((e0-i*hf)/e0)**3 * ((S**i)/np.math.factorial(i)) * np.exp(-4*np.log(2)*((x-e0+i*hf)/fwhm)**2)

其中 Ae0hfSfwhm通过一些良好的初始猜测从拟合中确定。 重要的是,参数 i 从 0 开始,每增加一个组件就增加 1。

因此,对于 N = 3,表达式将采用以下形式:

A * ((e0-0*hf)/e0)**3 * ((S**0)/np.math.factorial(0)) * np.exp(-4*np.log(2)*((x-e0+0*hf)/fwhm)**2) +
A * ((e0-1*hf)/e0)**3 * ((S**1)/np.math.factorial(1)) * np.exp(-4*np.log(2)*((x-e0+1*hf)/fwhm)**2) +
A * ((e0-2*hf)/e0)**3 * ((S**2)/np.math.factorial(2)) * np.exp(-4*np.log(2)*((x-e0+2*hf)/fwhm)**2)

i 之外的所有参数对于求和中的每个分量都是恒定的,这是预期的。 i 正在以受控方式根据参数数量变化。

我正在使用curve_fit。对拟合例程进行编码的一种方法是为任何合理的 N 明确定义表达式,并仅使用适当的表达式。比如,这里应该是 5 或 6,这取决于间距,间距由 hf 决定。我可以定义一个包含 N 个组件的长函数,在每个组件中写入一个合适的 i 值。我了解如何做到这一点(并且做到了)。但我想更聪明地对此进行编码。我的目标是编写一个函数,它可以接受任何 N 值,如上所述添加适当数量的组件,在正确增加 i 的同时计算表达式并返回结果。

我尝试了各种各样的事情。我的主要障碍是我不知道如何告诉程序使用特定的 N 和相应的 i 值。最后,经过一番搜索,我想我找到了一种使用 lambda 函数对其进行编码的好方法。

from scipy.optimize import curve_fit
import numpy as np

def fullfunc(x,p,n):
    def func(x,A,e0,hf,S,fwhm,i):
        return A * ((e0-i*hf)/e0)**3 * ((S**i)/np.math.factorial(i)) * np.exp(-4*np.log(2)*((x-e0+i*hf)/fwhm)**2)
    y_fit = np.zeros_like(x)
    for i in range(n):
        y_fit += func(x,p[0],p[1],p[2],p[3],p[4],i)
    return y_fit
p = [1,26000,1400,1,1000]
x = [27027,25062,23364,21881,20576,19417,18382,17452,16611,15847,15151]
y = [0.01,0.42,0.93,0.97,0.65,0.33,0.14,0.06,0.02,0.01,0.004]
n = 7
fittedParameters,pcov = curve_fit(lambda x,p: fullfunc(x,n),x,y,p)
A,fwhm = fittedParameters

这给出:

TypeError: <lambda>() takes 2 positional arguments but 7 were given

我不明白为什么。我有一种感觉,lambda 函数无法处理初始参数列表。 我非常感谢任何关于如何在不明确写出所有方程的情况下使这项工作有效的建议,因为我发现这有点太死板了。 提供的 x 和 y 范围是真实数据的样本,可以大致了解形状是什么。

解决方法

由于您仅在范围 i=0,1,...,n-1 上使用求和,因此无需参考复杂的 lambda 构造,这些构造在曲线拟合的上下文中可能有效也可能无效。只需将您的拟合函数定义为 n 分量的总和:

from matplotlib import pyplot as plt
from scipy.optimize import curve_fit
import numpy as np

def func(x,A,e0,hf,S,fwhm):
    return sum((A * ((e0-i*hf)/e0)**3 * ((S**i)/np.math.factorial(i)) * np.exp(-4*np.log(2)*((x-e0+i*hf)/fwhm)**2)) for i in range(n))

p = [1,26000,1400,1000]
x = [27027,25062,23364,21881,20576,19417,18382,17452,16611,15847,15151]
y = [0.01,0.42,0.93,0.97,0.65,0.33,0.14,0.06,0.02,0.01,0.004]
n = 7
fittedParameters,pcov = curve_fit(func,x,y,p0=p)
#A,fwhm = fittedParameters

print(fittedParameters)
plt.plot(x,"ro",label="data")
x_fit = np.linspace(min(x),max(x),100)
y_fit = func(x_fit,*fittedParameters)
plt.plot(x_fit,y_fit,label="fit")
plt.legend()
plt.show()

示例输出:

enter image description here

P.S.:从表面上看,这些数据点已经很好地拟合了 n=1

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。

相关推荐


使用本地python环境可以成功执行 import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt # 设置字体 plt.rcParams[&#39;font.sans-serif&#39;] = [&#39;SimHei&#39;] # 能正确显示负号 p
错误1:Request method ‘DELETE‘ not supported 错误还原:controller层有一个接口,访问该接口时报错:Request method ‘DELETE‘ not supported 错误原因:没有接收到前端传入的参数,修改为如下 参考 错误2:cannot r
错误1:启动docker镜像时报错:Error response from daemon: driver failed programming external connectivity on endpoint quirky_allen 解决方法:重启docker -&gt; systemctl r
错误1:private field ‘xxx‘ is never assigned 按Altʾnter快捷键,选择第2项 参考:https://blog.csdn.net/shi_hong_fei_hei/article/details/88814070 错误2:启动时报错,不能找到主启动类 #
报错如下,通过源不能下载,最后警告pip需升级版本 Requirement already satisfied: pip in c:\users\ychen\appdata\local\programs\python\python310\lib\site-packages (22.0.4) Coll
错误1:maven打包报错 错误还原:使用maven打包项目时报错如下 [ERROR] Failed to execute goal org.apache.maven.plugins:maven-resources-plugin:3.2.0:resources (default-resources)
错误1:服务调用时报错 服务消费者模块assess通过openFeign调用服务提供者模块hires 如下为服务提供者模块hires的控制层接口 @RestController @RequestMapping(&quot;/hires&quot;) public class FeignControl
错误1:运行项目后报如下错误 解决方案 报错2:Failed to execute goal org.apache.maven.plugins:maven-compiler-plugin:3.8.1:compile (default-compile) on project sb 解决方案:在pom.
参考 错误原因 过滤器或拦截器在生效时,redisTemplate还没有注入 解决方案:在注入容器时就生效 @Component //项目运行时就注入Spring容器 public class RedisBean { @Resource private RedisTemplate&lt;String
使用vite构建项目报错 C:\Users\ychen\work&gt;npm init @vitejs/app @vitejs/create-app is deprecated, use npm init vite instead C:\Users\ychen\AppData\Local\npm-
参考1 参考2 解决方案 # 点击安装源 协议选择 http:// 路径填写 mirrors.aliyun.com/centos/8.3.2011/BaseOS/x86_64/os URL类型 软件库URL 其他路径 # 版本 7 mirrors.aliyun.com/centos/7/os/x86
报错1 [root@slave1 data_mocker]# kafka-console-consumer.sh --bootstrap-server slave1:9092 --topic topic_db [2023-12-19 18:31:12,770] WARN [Consumer clie
错误1 # 重写数据 hive (edu)&gt; insert overwrite table dwd_trade_cart_add_inc &gt; select data.id, &gt; data.user_id, &gt; data.course_id, &gt; date_format(
错误1 hive (edu)&gt; insert into huanhuan values(1,&#39;haoge&#39;); Query ID = root_20240110071417_fe1517ad-3607-41f4-bdcf-d00b98ac443e Total jobs = 1
报错1:执行到如下就不执行了,没有显示Successfully registered new MBean. [root@slave1 bin]# /usr/local/software/flume-1.9.0/bin/flume-ng agent -n a1 -c /usr/local/softwa
虚拟及没有启动任何服务器查看jps会显示jps,如果没有显示任何东西 [root@slave2 ~]# jps 9647 Jps 解决方案 # 进入/tmp查看 [root@slave1 dfs]# cd /tmp [root@slave1 tmp]# ll 总用量 48 drwxr-xr-x. 2
报错1 hive&gt; show databases; OK Failed with exception java.io.IOException:java.lang.RuntimeException: Error in configuring object Time taken: 0.474 se
报错1 [root@localhost ~]# vim -bash: vim: 未找到命令 安装vim yum -y install vim* # 查看是否安装成功 [root@hadoop01 hadoop]# rpm -qa |grep vim vim-X11-7.4.629-8.el7_9.x
修改hadoop配置 vi /usr/local/software/hadoop-2.9.2/etc/hadoop/yarn-site.xml # 添加如下 &lt;configuration&gt; &lt;property&gt; &lt;name&gt;yarn.nodemanager.res