使用 networkx 和 bokeh 在 Holoviews 中按类着色节点并将类添加为 vdim

如何解决使用 networkx 和 bokeh 在 Holoviews 中按类着色节点并将类添加为 vdim

所以我试图根据类别为我的节点着色，比如 categories = ['a','b','c']

for comb in data:
    edges.append((comb['comb'][0],comb['comb'][1],comb['count']))
      
graph = hv.Graph(edges,vdims='weight') 
graph = layout_nodes(graph,layout=nx.layout.fruchterman_reingold_layout,kwargs={'weight': 'weight'})
nodes_array = graph.nodes.array()
for node in nodes_array:
    (node) #add vdim to node here and set node_color to this vdim?
labels = hv.Labels(([i[0] for i in nodes_array],[i[1] for i in nodes_array],[i[2] for i in nodes_array]))

(graph.opts(width=800,height=800,node_color='weight')*labels.opts(text_font_size='8pt',text_color='blue')) 

我需要的是一种方法来做到这一点，我想我需要为每个节点设置类别，以某种方式将其定义为一个 vdim，然后将 node_color 设置为这个 vdim？

我看到了有关特定节点和类似节点的其他问题，但我认为我无法定义节点（包括位置），因为我需要 fruchterman_reingold_layout 来为我执行此操作。

（如果有办法改变节点的大小，则奖励）

编辑： 因此，我还尝试通过 add_dimension 添加维度，如此处的文档所示：http://holoviews.org/user_guide/Dimensioned_Containers.html

graph.nodes.add_dimension('weight',dim_pos=3,dim_val=['a'] * 457) 457 是我的节点数，这是正确的，但我收到以下错误： ValueError: kdims: list length must be between 3 and 3 (inclusive) 我也不知道如何处理函数的结果，我想以某种方式将其设置为新节点？

解决方法

回答我自己的问题，因为我找到了一种方法来实现我想要的结果。 它更像是一种解决方法而不是干净的解决方案，但它有效，因此可能对其他人有所帮助，直到有更好的答案。

from holoviews.element.graphs import layout_nodes
import random
G = hv.Graph([
    ('a','b',3),('a','c',0.2),('c','d',0.1),'e',0.7),'f',5),0.3)
],vdims=['weight'])

G = layout_nodes(G,layout=nx.layout.fruchterman_reingold_layout,kwargs={'weight': 'weight'})
nodes_array = G.nodes.array()
newNodes_array = []
for node in nodes_array:
    newNodes_array.append((node[0],node[1],node[2],random.choice(['class1','class2','class3'])))
N = hv.Nodes(newNodes_array,vdims='class')

labels = hv.Labels(([i[0] for i in nodes_array],[i[1] for i in nodes_array],[i[2] for i in nodes_array]))
G*(N).opts(color = 'class',cmap='Set1')*labels

G.nodes.array() 在应用所需的 nx.layout.fruchterman_reingold_layout 后被复制，因此可以向这些节点添加新维度并将它们与图形一起绘制。 输出：